178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_pTet0028 on replicon NC_008790
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010657  SbBS512_0037  triC protein  38.42 
 
 		 915 aa  646    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0028  cmgB3/4  100 
 
 		 922 aa  1883    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  66.52 
 
 		 924 aa  1285    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0180  cmgb3/4  55.97 
 
 		 561 aa  664    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6325  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  38.72 
 
 		 829 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0066  type IV secretion system protein VirB4  37.81 
 
 		 831 aa  553  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0274973  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0060  type IV secretion system protein VirB4  37.68 
 
 		 831 aa  549  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1487  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  34.57 
 
 		 915 aa  543  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0108  TriC protein  34.46 
 
 		 916 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0102  pilx4 protein  36.3 
 
 		 876 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.894843 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1756  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  33.7 
 
 		 830 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0450  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  33.75 
 
 		 823 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2441  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  33.66 
 
 		 815 aa  467  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06702  normal  0.584537 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0163  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  34.39 
 
 		 822 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2655  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  33.58 
 
 		 822 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6504  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  33.92 
 
 		 821 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4851  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  31.94 
 
 		 826 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3315  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  31.94 
 
 		 826 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4200  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  31.94 
 
 		 826 aa  426  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0870  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  30.84 
 
 		 830 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  31.11 
 
 		 805 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1137  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  31.49 
 
 		 816 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  29.67 
 
 		 788 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  30.66 
 
 		 793 aa  382  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  29.4 
 
 		 790 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  30.21 
 
 		 796 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4445  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  27.87 
 
 		 803 aa  344  5e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.346994  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  28 
 
 		 839 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  28.42 
 
 		 805 aa  340  8e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  28.38 
 
 		 819 aa  335  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  29.64 
 
 		 800 aa  334  5e-90  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5816  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  26.96 
 
 		 835 aa  332  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  29.27 
 
 		 800 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  28.22 
 
 		 804 aa  327  5e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  27.4 
 
 		 785 aa  324  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  28.38 
 
 		 801 aa  323  8e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  29.05 
 
 		 803 aa  322  3e-86  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9821  type IV secretion protein AvhB4  28.38 
 
 		 819 aa  314  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8224  type IV secretion system protein VirB4  24.75 
 
 		 789 aa  273  9e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3523  type IV secretion system protein VirB4  26.11 
 
 		 797 aa  262  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6159  type IV secretion system protein VirB4  24.42 
 
 		 789 aa  258  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0089682  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0153  hypothetical protein  25.48 
 
 		 826 aa  254  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3819  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  25.19 
 
 		 791 aa  245  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.321786  normal  0.020067 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0171  hypothetical protein  24.88 
 
 		 826 aa  244  7e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3976  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  24.68 
 
 		 787 aa  239  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3641  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  25.19 
 
 		 791 aa  239  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.227146 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7347  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  24.17 
 
 		 849 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327754 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7534  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  25.03 
 
 		 857 aa  224  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0339872  normal  0.0463504 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5026  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  23.7 
 
 		 804 aa  218  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.451352  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0012  conjugal transfer protein  26.17 
 
 		 792 aa  211  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.829213 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08213  conjugal transfer protein TraE  24.06 
 
 		 752 aa  199  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6506  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.07 
 
 		 825 aa  161  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5609  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21.22 
 
 		 825 aa  157  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2821  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.22 
 
 		 827 aa  154  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.901669 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0030  conjugal transfer protein  23.86 
 
 		 841 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5465  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  21 
 
 		 850 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257739  decreased coverage  0.00704778 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1522  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.46 
 
 		 815 aa  145  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  21.56 
 
 		 824 aa  144  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4566  conjugal transfer protein TrbE  20.63 
 
 		 817 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6305  Type IV secretory pathway VirB4-like protein  21.93 
 
 		 818 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  21.98 
 
 		 819 aa  138  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1173  type IV secretion system protein VirB4, putative  21.46 
 
 		 788 aa  137  6.0000000000000005e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4747  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.05 
 
 		 844 aa  137  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290977 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5379  conjugal transfer protein TrbE  21.7 
 
 		 817 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325542 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0050  conjugal transfer protein TrbE  22.01 
 
 		 845 aa  134  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5485  conjugal transfer protein TrbE  20.27 
 
 		 815 aa  134  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00798845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  21.31 
 
 		 813 aa  133  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  21.23 
 
 		 808 aa  132  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5229  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  22 
 
 		 846 aa  130  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.738503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  22.07 
 
 		 810 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  19.65 
 
 		 819 aa  126  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9265  conjugal transfer protein TrbE  20.82 
 
 		 822 aa  125  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.502143  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2349  conjugal transfer ATPase TrbE  19.46 
 
 		 820 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2503  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  20.85 
 
 		 814 aa  122  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0963  conjugal transfer ATPase TrbE  22.07 
 
 		 813 aa  121  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4692  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  22.09 
 
 		 808 aa  121  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  20.23 
 
 		 813 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  19.65 
 
 		 817 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  19.6 
 
 		 816 aa  118  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1553  conjugal transfer ATPase TrbE  19.85 
 
 		 809 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2648  conjugal transfer ATPase TrbE  19.77 
 
 		 825 aa  117  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947837  normal  0.965174 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  20.98 
 
 		 687 aa  117  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  19.9 
 
 		 823 aa  117  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8331  conjugal transfer protein TrbE  20.53 
 
 		 820 aa  117  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359626  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3694  conjugal transfer ATPase TrbE  20.75 
 
 		 820 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  19.8 
 
 		 816 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30910  conjugal transfer ATPase TrbE  19.67 
 
 		 817 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000414209  unclonable  1.71741e-21 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1319  conjugal transfer ATPase TrbE  19.27 
 
 		 819 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3898  conjugal transfer ATPase TrbE  20.9 
 
 		 813 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  20.89 
 
 		 817 aa  115  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  19.57 
 
 		 811 aa  115  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  19.57 
 
 		 816 aa  114  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3538  conjugal transfer ATPase TrbE  21.12 
 
 		 813 aa  114  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0252817  normal  0.696341 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0839  type IV secretion system protein VirB5  20.66 
 
 		 791 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0234971  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  20.97 
 
 		 830 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2228  conjugal transfer protein TrbE  20.05 
 
 		 854 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0444639  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  19.77 
 
 		 823 aa  114  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7443  conjugal transfer ATPase TrbE  20.48 
 
 		 809 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0315  conjugal transfer ATPase TrbE  20.8 
 
 		 821 aa  112  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3830  conjugal transfer ATPase TrbE  21.29 
 
 		 818 aa  113  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>