More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_pTet0024 on replicon NC_008790
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  100 
 
 
204 aa  404  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  57.71 
 
 
200 aa  238  4e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3142  resolvase-like protein  42.08 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3410  Resolvase domain protein  36.96 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  34.83 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0172  resolvase family site-specific recombinase  33.17 
 
 
208 aa  104  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  40.88 
 
 
211 aa  103  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0864  multiple promoter invertase  35.68 
 
 
206 aa  101  6e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186706 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1950  multiple promoter invertase  38.71 
 
 
202 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  43.05 
 
 
184 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  42.38 
 
 
184 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  39.74 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  33.77 
 
 
192 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  33.56 
 
 
185 aa  92.8  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  39.74 
 
 
188 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  31.97 
 
 
212 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  39.2 
 
 
194 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  38.67 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  41.83 
 
 
197 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2368  Resolvase domain protein  30.24 
 
 
223 aa  89.4  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  decreased coverage  0.00000000117936 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  35.76 
 
 
189 aa  89  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  34.44 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  36.31 
 
 
183 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  36.84 
 
 
197 aa  85.9  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  33.7 
 
 
218 aa  85.9  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  32.62 
 
 
189 aa  85.9  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  30.94 
 
 
209 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  34.81 
 
 
185 aa  84.7  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  34.81 
 
 
185 aa  84.7  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  33.89 
 
 
188 aa  84.7  9e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  33.7 
 
 
188 aa  84.7  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3075  resolvase domain protein  32.91 
 
 
191 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  34.21 
 
 
198 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  35.67 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  31.28 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  34.69 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  34.69 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  31.84 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  34.69 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  33.33 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  37.16 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  33.94 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  33.15 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  29.83 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  29.83 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  35.1 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  31.49 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  32.96 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  34.84 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  33.33 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  36 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0523  resolvase-like protein  34.19 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  30.56 
 
 
192 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  30.56 
 
 
192 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  35.33 
 
 
189 aa  82  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  31.94 
 
 
189 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  33.77 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  32.74 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  36.42 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  37.16 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  35.37 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  35.37 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  35.37 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  35.37 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  35.37 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  35.37 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  35.37 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  35.37 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  35.37 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  33.77 
 
 
181 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  33.15 
 
 
185 aa  81.3  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  32.89 
 
 
176 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  33.56 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  34 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  37.09 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  32.07 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  34.39 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  34 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  32.6 
 
 
181 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  32.89 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  32.89 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  36.24 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  34.64 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  32.21 
 
 
212 aa  79  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  31.48 
 
 
190 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  33.15 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  33.15 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  34.23 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  34.39 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  34.87 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  31.79 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  35.14 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.97 
 
 
195 aa  77.8  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  34.21 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  34.21 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  34.21 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  34.25 
 
 
191 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  33.56 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  35.8 
 
 
189 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>