208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1598 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1783  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 87 aa  169  1e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1598  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 87 aa  169  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1965  30S ribosomal protein S20  98.85 
 
 		 87 aa  166  7e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0016  30S ribosomal protein S20  91.95 
 
 		 87 aa  155  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1806  30S ribosomal protein S20  83.72 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0293621  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  81.4 
 
 		 89 aa  138  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1718  30S ribosomal protein S20  75.86 
 
 		 88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1619  30S ribosomal protein S20  70.93 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  65.52 
 
 		 91 aa  103  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2044  30S ribosomal protein S20  60.47 
 
 		 86 aa  97.8  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0994  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.945897  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  50.57 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  50.57 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  48.1 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0792  ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0001  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  37.93 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  42.53 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  42.5 
 
 		 86 aa  57  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  45.98 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4890  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.540354  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3104  ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0094  ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3131  30S ribosomal protein S20  51.72 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7677  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118438  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0390  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 92 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 92 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2556  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3031  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.362644  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  45.57 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4943  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2765  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1037  ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4421  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0001  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  42.17 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2678  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.855392  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3143  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0071  30S ribosomal protein S20  38.27 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 88 aa  50.4  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1281  30S ribosomal protein S20  37.97 
 
 		 88 aa  50.1  0.000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000755686  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0041  30S ribosomal protein S20  38.27 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.418613  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2717  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4712  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4039  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0745  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.426088 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2904  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5323  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.761405  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2024  ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000205272  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0377  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1075  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0735  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0677  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2512  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3203  30S ribosomal protein S20  37.35 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0919  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459642  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0923  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0126  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 88 aa  48.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  38.75 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  36.67 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1756  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.443874  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2600  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>