15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1488 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1669  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  337  4e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1488  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  337  4e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1844  hypothetical protein  98.26 
 
 
172 aa  332  1e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0370  hypothetical protein  59.3 
 
 
171 aa  204  6e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1786  MTA/SAH nucleosidase  45.61 
 
 
188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000723674  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2129  ATPase, AAA family protein  43.83 
 
 
187 aa  122  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0372  pdp protein  41.9 
 
 
177 aa  110  8.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0184343  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1925  hypothetical protein  32.54 
 
 
175 aa  85.9  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0077  PDP protein  34.36 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.390146  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1686  hypothetical protein  28.44 
 
 
207 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0163498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0355  putative exported flagella related protein  31.03 
 
 
180 aa  44.3  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.900636  normal  0.0456506 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  31.9 
 
 
219 aa  44.7  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0323  putative exported flagella related protein  32.32 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547505  normal  0.420326 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0743  hypothetical protein  30.17 
 
 
189 aa  42.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.634607  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1134  MgtE intracellular region  31.08 
 
 
412 aa  40.8  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>