More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1474 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1654  putative recombination protein RecB  98.48 
 
 		 921 aa  1816    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1828  putative recombination protein RecB  97.29 
 
 		 921 aa  1772    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00117116  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1474  putative recombination protein RecB  100 
 
 		 921 aa  1843    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000740501  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0382  putative recombination protein RecB  46.25 
 
 		 915 aa  744    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309071  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0386  putative recombination protein RecB  38.84 
 
 		 921 aa  567  1e-160  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.717067  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0910  putative recombination protein RecB  36.85 
 
 		 933 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.646697  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1391  putative recombination protein RecB  36.96 
 
 		 923 aa  502  1e-140  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0736  putative recombination protein RecB  35.28 
 
 		 939 aa  486  1e-136  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1910  UvrD/REP helicase  34.54 
 
 		 907 aa  417  9.999999999999999e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0090  putative recombination protein RecB  33.47 
 
 		 903 aa  402  9.999999999999999e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0699  UvrD/REP helicase  25.96 
 
 		 1052 aa  178  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1797  Exodeoxyribonuclease V  24.67 
 
 		 1120 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00119316  normal  0.701381 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  25.36 
 
 		 1147 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  27.36 
 
 		 1183 aa  131  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03180  putative helicase  26.62 
 
 		 1054 aa  129  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.927265  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  26.5 
 
 		 1125 aa  127  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  27.69 
 
 		 1121 aa  127  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  27.31 
 
 		 1183 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  27.02 
 
 		 1124 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  26.95 
 
 		 1119 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  25.31 
 
 		 1106 aa  118  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  25.31 
 
 		 1106 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  26.07 
 
 		 1182 aa  116  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  27.07 
 
 		 1173 aa  113  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  27.51 
 
 		 1185 aa  112  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  25.73 
 
 		 1168 aa  110  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  27.36 
 
 		 1156 aa  108  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4180  Exodeoxyribonuclease V  24.07 
 
 		 1073 aa  107  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0648836 
 
 
-
 
NC_002950  PG2072  UvrD/REP helicase domain-containing protein  25.05 
 
 		 1102 aa  106  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0648  UvrD/REP helicase  23.55 
 
 		 1140 aa  106  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464664  normal  0.326348 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1588  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.77 
 
 		 1067 aa  106  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1741  UvrD/REP helicase  26.01 
 
 		 1162 aa  105  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.616964  hitchhiker  0.00243499 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0387  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.16 
 
 		 860 aa  105  5e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0495  UvrD/REP helicase  24.51 
 
 		 981 aa  103  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0202  UvrD/REP helicase  25.15 
 
 		 1159 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1136  UvrD/REP helicase  25.53 
 
 		 1112 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0229402 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0252  UvrD/REP helicase  27.18 
 
 		 1060 aa  103  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  26.37 
 
 		 1089 aa  102  3e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1503  UvrD/REP helicase  25.67 
 
 		 1101 aa  102  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699543  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2355  UvrD/REP helicase  25.23 
 
 		 1101 aa  102  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1285  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.16 
 
 		 1086 aa  100  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.100578 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  39.07 
 
 		 1110 aa  100  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1697  UvrD/REP helicase  23.72 
 
 		 1182 aa  99.8  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1775  hypothetical protein  34.1 
 
 		 1076 aa  96.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  38.41 
 
 		 1110 aa  96.3  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04140  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 1036 aa  95.5  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  23.71 
 
 		 1161 aa  94.4  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1776  hypothetical protein  34.86 
 
 		 1076 aa  94.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  21.6 
 
 		 1156 aa  90.5  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0006  UvrD/REP helicase  23.99 
 
 		 945 aa  88.6  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.416534  hitchhiker  0.0000067994 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  31.15 
 
 		 1120 aa  88.2  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1057 aa  88.6  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.27 
 
 		 1183 aa  87.8  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  26.98 
 
 		 1161 aa  86.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  26.3 
 
 		 1033 aa  85.9  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  26 
 
 		 1343 aa  85.9  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4904  double-strand break repair helicase AddA  30.52 
 
 		 1147 aa  85.9  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.921527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  26.02 
 
 		 1161 aa  86.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4440  double-strand break repair helicase AddA  30.52 
 
 		 1147 aa  85.9  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.548671  normal  0.292809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  30.41 
 
 		 1147 aa  85.5  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0629  UvrD/REP helicase  33.57 
 
 		 1161 aa  85.1  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.590503 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  24.17 
 
 		 1184 aa  84.7  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0489  double-strand break repair helicase AddA  33.33 
 
 		 1157 aa  84  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127792  hitchhiker  0.00205602 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0723  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 1196 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  30.52 
 
 		 1185 aa  83.2  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1455  UvrD-like DNA helicase, C terminal  27.56 
 
 		 1157 aa  82.8  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.719405  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  32.73 
 
 		 1157 aa  82.8  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1166  UvrD/REP helicase  27.92 
 
 		 1152 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.638752 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0644  UvrD/REP helicase  28.11 
 
 		 1109 aa  82  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0914  hypothetical protein  34.57 
 
 		 913 aa  82.4  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.230756 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0764  UvrD/REP helicase  23.86 
 
 		 1161 aa  82.4  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4011  UvrD/REP helicase  23.26 
 
 		 1083 aa  81.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0387  UvrD/REP helicase  32.37 
 
 		 1164 aa  81.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0979  UvrD/REP helicase  28.88 
 
 		 1173 aa  81.6  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.156033  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  26.94 
 
 		 1095 aa  81.3  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  25.97 
 
 		 1151 aa  80.5  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  35.76 
 
 		 1180 aa  80.1  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  35.25 
 
 		 854 aa  79.7  0.0000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1610  double-strand break repair helicase AddA  33.33 
 
 		 1157 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3377  double-strand break repair helicase AddA  33.83 
 
 		 1165 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.291395  normal  0.767589 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  32.34 
 
 		 1177 aa  79.3  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3622  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.7 
 
 		 1135 aa  79.3  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0988  UvrD/REP helicase  34.51 
 
 		 1146 aa  78.6  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181635  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0973  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  39.06 
 
 		 1155 aa  78.6  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117254 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  28.17 
 
 		 666 aa  78.6  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0050  UvrD/REP helicase  24.15 
 
 		 1202 aa  78.2  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.253682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  33.33 
 
 		 1187 aa  78.2  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1751  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  42.86 
 
 		 1129 aa  77.8  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.910924 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1561  UvrD/REP helicase  30.95 
 
 		 1054 aa  77.8  0.0000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0011  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.4 
 
 		 1241 aa  77.8  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.19 
 
 		 1200 aa  77.8  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3242  double-strand break repair helicase AddA  38.54 
 
 		 1189 aa  77  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1708  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  40.57 
 
 		 1118 aa  77.4  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  32.34 
 
 		 1087 aa  76.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1975  UvrD/REP helicase  40.37 
 
 		 1132 aa  77  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.109081  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.19 
 
 		 1197 aa  76.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0058  UvrD/REP helicase  22.75 
 
 		 1162 aa  76.6  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106754  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3742  UvrD/REP helicase  24.77 
 
 		 1142 aa  76.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.404574  normal  0.909717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.93 
 
 		 1168 aa  76.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  28.83 
 
 		 1187 aa  75.9  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>