96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1439 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1619  capsular polysaccharide ABC transporter  100 
 
 		 372 aa  743    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1439  capsular polysaccharide ABC transporter  100 
 
 		 372 aa  743    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1780  capsular polysaccharide ABC transporter  91.94 
 
 		 372 aa  690    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0292  capsular polysaccharide export inner-membrane protein KpsE  64.31 
 
 		 371 aa  458  9.999999999999999e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0622  capsular polysaccharide ABC transporter  40.46 
 
 		 367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.22942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3904  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.9 
 
 		 368 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.122006 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02815  Capsule polysaccharide export inner-membrane protein kpsE  35.04 
 
 		 378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000139035  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.05 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3220  polysialic acid capsule export inner-membrane protein KpsE  35.04 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02765  hypothetical protein  35.04 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000109995  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1304  chain length determinant protein  31.62 
 
 		 360 aa  195  9e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03061  putative capsule polysaccharide export system inner membrane protein  32.28 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.244553  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3238  lipopolysaccharide biosynthesis  30.95 
 
 		 483 aa  192  9e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5730  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein  29.62 
 
 		 368 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2583  capsule polysaccharide export protein-like protein  27.27 
 
 		 436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000174654 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4939  lipopolysaccharide biosynthesis  30.88 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2756  capsule polysaccharide export protein-like  27.42 
 
 		 400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.415519  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001782  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  27.64 
 
 		 381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5953  capsule polysaccharide export protein-like protein  28.21 
 
 		 383 aa  159  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0295  lipopolysaccharide biosynthesis  27.67 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0778  lipopolysaccharide biosynthesis  27.67 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3253  capsule polysaccharide exporter  27.95 
 
 		 515 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.51682  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3300  WcbD  27.95 
 
 		 465 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0873208  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1077  capsule polysaccharide exporter  27.95 
 
 		 515 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.112896  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2184  capsule polysaccharide exporter  27.95 
 
 		 515 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0522  capsule polysaccharide exporter  27.95 
 
 		 515 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122363  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3288  capsule polysaccharide exporter  27.95 
 
 		 515 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4996  capsule polysaccharide export protein-like protein  32.15 
 
 		 443 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0773002 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3869  capsule polysaccharide export protein-like  26.81 
 
 		 380 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1522  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.56 
 
 		 385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4014  capsule polysaccharide export-like protein  24.37 
 
 		 387 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0746  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  24.09 
 
 		 365 aa  129  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3997  hypothetical protein  25.88 
 
 		 492 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.740683  normal  0.827295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5579  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.84 
 
 		 413 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.906457 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1507  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5053  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.78 
 
 		 436 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.522241 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2346  lipopolysaccharide biosynthesis  25.93 
 
 		 399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4085  capsule polysaccharide export protein-like  27.13 
 
 		 379 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.387523  normal  0.315996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2049  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.35 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2721  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.29 
 
 		 411 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1658  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.84 
 
 		 413 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2961  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  25.87 
 
 		 371 aa  122  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2574  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 		 371 aa  122  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0747  WcbD  27.22 
 
 		 390 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4085  capsule polysaccharide export protein-like protein  24.36 
 
 		 448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160773  normal  0.368018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4566  capsule polysaccharide export protein-like protein  24.71 
 
 		 448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4453  capsule polysaccharide export protein-like protein  24.36 
 
 		 448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1852  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.87 
 
 		 433 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1337  WcbD  28.94 
 
 		 388 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3838  capsule polysaccharide export protein  26.44 
 
 		 611 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4871  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.86 
 
 		 433 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.34888 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0713  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  25.63 
 
 		 415 aa  116  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4076  capsule polysaccharide export protein  26.89 
 
 		 491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054878 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1150  WcbD  29.11 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0184519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2087  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.44 
 
 		 414 aa  113  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18684 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5038  capsule polysaccharide export protein-like  27.54 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3812  capsule polysaccharide export protein-like protein  23.82 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.879511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0662  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein CtrB  25.14 
 
 		 391 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.0442626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6013  capsule polysaccharide export protein-like protein  27.68 
 
 		 421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2126  capsule polysaccharide export protein-like  27.54 
 
 		 652 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0775  capsule polysaccharide export protein-like protein  25 
 
 		 414 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.069247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0816  capsule polysaccharide export protein-like protein  25 
 
 		 414 aa  107  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.671336  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2037  polysaccharide ABC transporter  24.48 
 
 		 402 aa  106  6e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.126428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2731  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.72 
 
 		 394 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1234  capsule polysaccharide export protein-like  22.86 
 
 		 579 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195673  normal  0.85548 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0632  polysaccharide ABC transporter  23.65 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0379195  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2722  capsule polysaccharide export protein-like protein  23.39 
 
 		 432 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0737  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.36 
 
 		 414 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0654  capsule polysaccharide export protein-like  24.52 
 
 		 585 aa  97.1  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0711  Capsule polysaccharide export protein  20.29 
 
 		 415 aa  93.6  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2082  capsule polysaccharide export-like protein  25.99 
 
 		 407 aa  89.4  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0722  putative capsule polysaccharide export ABC transporter transmembrane protein  23.76 
 
 		 385 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0435  capsule polysaccharide export protein-like protein  23.99 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00121431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3817  capsule polysaccharide export protein-like protein  21.51 
 
 		 430 aa  87  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3819  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.670333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0584  capsule polysaccharide export  22.34 
 
 		 569 aa  82.8  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0789  lipopolysaccharide biosynthesis  23.55 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1855  capsule polysaccharide export protein, putative  23.48 
 
 		 406 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722635  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3657  capsule polysaccharide export protein-like  22.76 
 
 		 590 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  23.53 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.716445  hitchhiker  0.000227002 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3402  lipopolysaccharide biosynthesis  25.11 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0889  lipopolysaccharide biosynthesis  21.91 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.6181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1234  lipopolysaccharide biosynthesis  23.77 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1511  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.11 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2235  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.99 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 		 395 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1985  chain length determinant domain-containing protein  24.89 
 
 		 405 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.75 
 
 		 384 aa  52.8  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1346  lipopolysaccharide biosynthesis  25.11 
 
 		 401 aa  52.8  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000737646 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0661  chain length determinant protein  24 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0567  chain length determinant protein  24 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1960  putative transport-related membrane protein  24 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.954505  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3061  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.43 
 
 		 416 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2625  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.16 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00623391  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.46 
 
 		 463 aa  47  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  31.03 
 
 		 472 aa  43.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>