More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1366 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  66.31 
 
 
462 aa  635    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1556  fumarate hydratase  99.14 
 
 
463 aa  950    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433937  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  66.67 
 
 
462 aa  638    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  66.24 
 
 
462 aa  636    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  66.31 
 
 
462 aa  637    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  66.31 
 
 
462 aa  635    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0285  fumarate hydratase  98.7 
 
 
463 aa  947    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  66.67 
 
 
462 aa  638    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1049  fumarate hydratase  67.17 
 
 
463 aa  660    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.62891  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  96.75 
 
 
463 aa  932    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1366  fumarate hydratase  100 
 
 
463 aa  957    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.862526  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1795  fumarate hydratase, class II  67.67 
 
 
465 aa  651    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  66.45 
 
 
462 aa  638    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0965  fumarate hydratase, class II  69.83 
 
 
465 aa  673    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  66.02 
 
 
462 aa  637    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  66.09 
 
 
462 aa  634  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3561  fumarate hydratase  65.81 
 
 
462 aa  634  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1636  fumarate hydratase  65.16 
 
 
462 aa  624  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545327  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  62.8 
 
 
470 aa  606  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  61.93 
 
 
467 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  61.69 
 
 
462 aa  599  1e-170  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  61.71 
 
 
465 aa  598  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  62.14 
 
 
467 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  62.14 
 
 
467 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  62.14 
 
 
467 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  62.14 
 
 
467 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  62.14 
 
 
467 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  62.99 
 
 
464 aa  596  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  61.27 
 
 
465 aa  594  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1120  fumarate hydratase  61.87 
 
 
456 aa  597  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  62.14 
 
 
467 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  62.14 
 
 
467 aa  592  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1387  fumarate hydratase  62.26 
 
 
461 aa  593  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.987993  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  61.3 
 
 
461 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  62.77 
 
 
463 aa  594  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  62.14 
 
 
467 aa  592  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  62.14 
 
 
467 aa  592  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  62.14 
 
 
467 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  61.3 
 
 
461 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  60.57 
 
 
465 aa  594  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  60.43 
 
 
461 aa  588  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  61.22 
 
 
464 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  61.22 
 
 
464 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  61.71 
 
 
459 aa  588  1e-167  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  61.22 
 
 
464 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  61.93 
 
 
467 aa  590  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  61.22 
 
 
464 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  61.18 
 
 
463 aa  589  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  61.22 
 
 
464 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  61.93 
 
 
467 aa  590  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  61.93 
 
 
467 aa  589  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  61.49 
 
 
631 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  60.83 
 
 
463 aa  586  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  61.66 
 
 
467 aa  587  1e-166  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1939  fumarate hydratase  60.95 
 
 
461 aa  586  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  60.35 
 
 
464 aa  586  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  61.22 
 
 
466 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  60.61 
 
 
464 aa  584  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  61.49 
 
 
459 aa  585  1e-166  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  60.35 
 
 
464 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  61.22 
 
 
467 aa  585  1e-166  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  60.35 
 
 
464 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1905  fumarate hydratase  60.95 
 
 
461 aa  586  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0427155  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  60.57 
 
 
464 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  60.48 
 
 
464 aa  587  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  60.35 
 
 
464 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  60.35 
 
 
464 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  59.74 
 
 
465 aa  585  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  61 
 
 
464 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  59.74 
 
 
471 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  59.69 
 
 
474 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  59.61 
 
 
468 aa  580  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  59.57 
 
 
461 aa  578  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  59.96 
 
 
465 aa  577  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  59.52 
 
 
463 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  58.44 
 
 
462 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  60.74 
 
 
464 aa  576  1.0000000000000001e-163  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3332  fumarase  60.04 
 
 
469 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  59.52 
 
 
465 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  59.83 
 
 
464 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  62.26 
 
 
464 aa  573  1.0000000000000001e-162  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  59.83 
 
 
464 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  59.52 
 
 
463 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  59.52 
 
 
465 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  59.3 
 
 
465 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  60.78 
 
 
464 aa  570  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0420  fumarate hydratase  57.27 
 
 
463 aa  566  1e-160  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.425613  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  60.57 
 
 
466 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  60.39 
 
 
466 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  59.83 
 
 
544 aa  555  1e-157  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  59.09 
 
 
463 aa  557  1e-157  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  58.95 
 
 
482 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  59.31 
 
 
462 aa  553  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  59.22 
 
 
492 aa  551  1e-156  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  57.7 
 
 
462 aa  548  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  57.95 
 
 
466 aa  548  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  57.64 
 
 
469 aa  550  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2016  fumarate hydratase  59.04 
 
 
463 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  57.73 
 
 
463 aa  548  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  56.16 
 
 
472 aa  545  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.104385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>