153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1280 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1280  hydrogenase maturation protease HydD  100 
 
 
178 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00834079  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1400  hydrogenase maturation protease HydD  98.88 
 
 
178 aa  361  3e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0462  hydrogenase maturation protease HydD  94.35 
 
 
178 aa  346  9e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000346095  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0715  Ni/Fe hydrogenase, expression/formation protein  70.06 
 
 
177 aa  269  2e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.930335  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0937  hydrogenase maturation protease HydD  59.88 
 
 
179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.353395  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1900  hydrogenase maturation protease superfamily  59.3 
 
 
179 aa  214  5e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0098  hydrogenase maturation protease HydD  59.88 
 
 
180 aa  214  8e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0404839  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0864  hydrogenase maturation protease HydD  54.34 
 
 
181 aa  206  2e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1103  hydrogenase maturation protease  50.57 
 
 
179 aa  199  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2096  hydrogenase expression/formation protein  47.73 
 
 
192 aa  179  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1819  hydrogenase expression/formation protein  47.73 
 
 
192 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2158  hydrogenase expression/formation protein  47.73 
 
 
192 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.6852  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1877  hydrogenase expression/formation protein  47.73 
 
 
192 aa  179  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1762  hydrogenase expression/formation protein  46.33 
 
 
187 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1676  hydrogenase expression/formation protein  51.22 
 
 
185 aa  178  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2091  hydrogenase expression/formation protein  48.02 
 
 
187 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.910871  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2030  hydrogenase expression/formation protein  45.45 
 
 
185 aa  177  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1433  peptidase M52, hydrogenase expression/formation protein  44.32 
 
 
181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.50886  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1886  hydrogenase expression/formation protein  47.46 
 
 
185 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2407  hydrogenase expression/formation protein  47.73 
 
 
185 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132093  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1912  hydrogenase expression/formation protein  47.73 
 
 
185 aa  167  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1905  hydrogenase expression/formation protein  46.59 
 
 
185 aa  167  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0136333 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1919  hydrogenase expression/formation protein  47.73 
 
 
185 aa  167  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2106  hydrogenase maturation protease  41.48 
 
 
184 aa  158  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2036  peptidase M52, hydrogen uptake protein  34.81 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  27.95 
 
 
170 aa  89.4  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  29.63 
 
 
165 aa  87.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  29.75 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  31.71 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  29.94 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  32.18 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  32.33 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  34.09 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  31.18 
 
 
172 aa  77.4  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  33.81 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  31.58 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  31.85 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.58 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  33.57 
 
 
159 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  33.9 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  29.27 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  32.89 
 
 
161 aa  72  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  29.27 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.47 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.47 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.47 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.47 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.47 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  33.05 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  34.31 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  27.11 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  30.67 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.12 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1968  hydrogenase maturation protease  30.58 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.12 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  28.12 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  28.12 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  28.12 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  34.15 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.12 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.12 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.12 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.12 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  30.17 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  29.61 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0858  hydrogenase maturation protease  32.12 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3406  hydrogenase maturation protease  30.95 
 
 
191 aa  62  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  27.45 
 
 
166 aa  61.6  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  34.96 
 
 
181 aa  61.6  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  30.63 
 
 
158 aa  60.8  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  30.63 
 
 
158 aa  60.8  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  33.9 
 
 
214 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  30.47 
 
 
172 aa  59.7  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.66 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  33.6 
 
 
170 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  30.47 
 
 
221 aa  58.9  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  29.71 
 
 
157 aa  58.9  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3986  HyaD peptidase  30 
 
 
204 aa  57.8  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  29.92 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  30.94 
 
 
209 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  30.77 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  30.43 
 
 
195 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  28.83 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1449  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.73 
 
 
158 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230112  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  30.51 
 
 
195 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1271  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.71 
 
 
167 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.813931  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  27.39 
 
 
207 aa  55.1  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1380  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.58 
 
 
156 aa  54.7  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0298181  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  26.55 
 
 
206 aa  54.3  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  29.66 
 
 
198 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  29.66 
 
 
198 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  29.66 
 
 
198 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  29.66 
 
 
198 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  26.92 
 
 
208 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  30.51 
 
 
195 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  29.66 
 
 
198 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  29.77 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  30.51 
 
 
195 aa  53.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  29.93 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1590  hydrogenase maturation protease  32.77 
 
 
160 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>