39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1170 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1289  cytochrome c553  100 
 
 
100 aa  202  1e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1170  cytochrome c553  100 
 
 
100 aa  202  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0575  cytochrome c553  99 
 
 
100 aa  201  4e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.673779  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0474  cytochrome c family protein  84 
 
 
101 aa  175  2e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1418  cytochrome c553  51.92 
 
 
104 aa  101  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.785663  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1416  cytochrome c553  49.04 
 
 
104 aa  99.4  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0241  cytochrome c-553 (cytochrome c553) (low-potential cytochromec)  50.5 
 
 
100 aa  97.8  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0084  glutamate racemase 2  51.49 
 
 
100 aa  95.9  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000295238  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1235  cytochrome c553  50.54 
 
 
105 aa  89  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1602  cytochrome c553  38.55 
 
 
155 aa  67  0.00000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.330816  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2134  cytochrome c family protein  34.65 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2244  cytochrome c class I  34.65 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2138  cytochrome c family protein  34.65 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.203882 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1817  cytochrome c class I  34.65 
 
 
98 aa  51.2  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1343  cytochrome c, class I  34.83 
 
 
103 aa  50.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.022471  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0539  cytochrome c class I  34.23 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113512 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0739  putative cytochrome c  31.63 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1570  cytochrome c, class I  37.8 
 
 
102 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0285899  normal  0.683196 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  31.94 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  33.96 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1821  cytochrome c-553  31.37 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000401467  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1108  hypothetical protein  30.77 
 
 
248 aa  45.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  30.84 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  33.33 
 
 
105 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  33.33 
 
 
105 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  33.33 
 
 
105 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3313  putative cytochrome C precursor-related protein  30.67 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477709  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1233  cytochrome c class I  32 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911336  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0759  cytochrome c, class I  34.82 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.940622  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  31.51 
 
 
110 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0335  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3829  cytochrome c, class I  34.38 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.82757  normal  0.284345 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2099  cytochrome c class I  29.21 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.149898 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  32.5 
 
 
238 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0127  cytochrome c class I  25.81 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5672  cytochrome c, class I  33.78 
 
 
119 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2249  cytochrome c class I  33.33 
 
 
119 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.802822 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2369  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
119 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166553  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0431  cytochrome c class I  36.61 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  5.40538e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>