More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1018 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1018  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 293 aa  576  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00162399  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1080  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 293 aa  576  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0284  LysR substrate-binding protein  35.49 
 
 		 294 aa  179  7e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3384  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 295 aa  118  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2659  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 313 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0266  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 313 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  29.15 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 318 aa  112  9e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  25 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  27.8 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  26.03 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  26.03 
 
 		 297 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1537  LysR family transcriptional regulator  26 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000701673  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2324  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.49 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0657  LysR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0325779  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  26.03 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2754  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.01 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2672  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.01 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1535  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.01 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0934769  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0953  transcriptional regulator, LysR family  26.62 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1657  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.73 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0307226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20130  LysR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1732  putative transcriptional regulator  24.32 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0186  LysR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000312054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1928  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.07 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0121617  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1434  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3225  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.66 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000454466 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  25.68 
 
 		 297 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2440  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.07 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.924518 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2348  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.07 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000261353  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2392  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.07 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.26292  hitchhiker  0.00212314 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2758  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.08 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2550  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.07 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2436  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.07 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0199714 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02086  predicted DNA-binding transcriptional regulator  24.75 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0640427  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0809  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.75 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02045  hypothetical protein  24.75 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.074382  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3293  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.75 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.020887  normal  0.438576 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1501  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2454  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.75 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2304  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.75 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791446 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0127  LysR family transcriptional regulator  21.58 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2293  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.75 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.73 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3595  LysR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1292  LysR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.781932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  25.95 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  25.95 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0269  LysR substrate-binding  29.09 
 
 		 298 aa  102  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1239  LysR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 308 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  hitchhiker  0.00000000418584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5024  LysR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0432035  normal  0.889367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4080  LysR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0726  LysR family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.414898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1637  LysR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4022  LysR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162423 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0951  LysR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2469  transcriptional regulator, LysR family protein  25.87 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1386  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  22.87 
 
 		 308 aa  99  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4025  transcriptional regulator, LysR family  22.87 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2879  LysR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417764 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1184  LysR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38480  FinR, transcriptional regulator, LysR-family  26.21 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6168  putative transcriptional regulator  23.21 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220915  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2375  LysR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  25.9 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1675  LysR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0630  transcriptional regulator, LysR family  29.12 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000148774  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  25.57 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1737  LysR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 308 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379475  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1882  LysR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0108244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1597  putative transcriptional regulator LysR-type  26.44 
 
 		 308 aa  95.9  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 334 aa  95.9  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0701  transcriptional regulator, LysR family  26.25 
 
 		 307 aa  95.9  8e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4465  transcriptional regulator, LysR family  27.36 
 
 		 319 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00192923  normal  0.232029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1679  LysR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 292 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1712  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 303 aa  95.5  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0262  LysR family transcriptional regulator  21.31 
 
 		 294 aa  95.5  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  28.23 
 
 		 303 aa  95.5  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2404  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000653141  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4402  transcriptional regulator, LysR family  27.36 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71090  LysR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 297 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4699  LysR family substrate binding transcriptional regulator  27.84 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2387  LysR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274334 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  28.88 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0265  transcriptional regulator, LysR family  31.91 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.399424  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4044  LysR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4331  LysR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2885  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>