74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0884 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0884  cytochrome c family protein, degenerate  100 
 
 
125 aa  260  4e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  68.25 
 
 
329 aa  186  7e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0259  cytochrome c class I  53.12 
 
 
331 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1092  cytochrome c class I  50 
 
 
333 aa  125  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  48.48 
 
 
369 aa  120  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2825  cytochrome c, class I  47.97 
 
 
329 aa  120  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137044  hitchhiker  0.000380249 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  49.59 
 
 
357 aa  120  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4873  cytochrome c class I  48.78 
 
 
306 aa  120  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2608  cytochrome c class I  49.59 
 
 
361 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2599  cytochrome c family protein  47.97 
 
 
306 aa  115  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.349522  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6947  cytochrome c class I  48.76 
 
 
358 aa  111  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  50.48 
 
 
675 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  47.62 
 
 
675 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.62 
 
 
726 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  47.78 
 
 
272 aa  89.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  53.09 
 
 
304 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  53.75 
 
 
310 aa  87  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  53.09 
 
 
304 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  45.28 
 
 
698 aa  87  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  53.09 
 
 
304 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  48.91 
 
 
327 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  46.15 
 
 
269 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  54.32 
 
 
304 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  46.39 
 
 
712 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  52.5 
 
 
291 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  43.81 
 
 
728 aa  84.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  44.76 
 
 
773 aa  84  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.57 
 
 
689 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  45.71 
 
 
721 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4236  cytochrome c class I  50.63 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185461  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  45.71 
 
 
721 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  45.71 
 
 
694 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1188  cytochrome c, class I  50 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0653  cytochrome c  42.86 
 
 
130 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963006  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.71 
 
 
699 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  46.15 
 
 
327 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  41.51 
 
 
669 aa  81.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1496  cytochrome c class I  45.37 
 
 
308 aa  81.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  42.86 
 
 
708 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1309  diheme-containing SoxA-like protein  50.63 
 
 
346 aa  80.5  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0128  putative cytochrome C  48.1 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0408235  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  43.88 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003030  cytochrome c family protein  51.9 
 
 
350 aa  79  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  49.37 
 
 
337 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  44.33 
 
 
691 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  50.63 
 
 
353 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  50.63 
 
 
293 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2378  cytochrome c, class I  48.1 
 
 
282 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000643985  hitchhiker  0.0000202689 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3545  cytochrome c family protein  53.16 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0544  cytochrome c class I  51.9 
 
 
355 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  51.9 
 
 
355 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0573  cytochrome c class I  51.9 
 
 
355 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0193  cytochrome c, class I  46.84 
 
 
327 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  51.9 
 
 
355 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000503789  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03090  putative cytochrome C signal peptide protein  34.88 
 
 
363 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.649207  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0690  cytochrome c class I  42.99 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  51.9 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0527  cytochrome c family protein  48.1 
 
 
352 aa  72  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000661478  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  50.63 
 
 
352 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  50.63 
 
 
351 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  50.63 
 
 
351 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2490  cytochrome c class I  45.45 
 
 
343 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  44.3 
 
 
313 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2105  cytochrome c, class I  41.86 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1476  cytochrome c class I  43.04 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2708  cytochrome c, class I  30 
 
 
343 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4179  cytochrome c, class I  35.64 
 
 
347 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402721  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  39 
 
 
309 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  44.44 
 
 
407 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  44.44 
 
 
407 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  38.27 
 
 
671 aa  60.8  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0051  cytochrome c family protein  41.98 
 
 
347 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0075  cytochrome c family protein  41.98 
 
 
347 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.667536  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0036  cytochrome c family protein  41.98 
 
 
347 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.170219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>