243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0777 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  100 
 
 
422 aa  849  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0487  restriction modification system DNA specificity subunit  35.24 
 
 
438 aa  256  6e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  34.95 
 
 
437 aa  220  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19070  hypothetical protein  31.28 
 
 
425 aa  195  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0871344 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1327  restriction modification system DNA specificity subunit  33.41 
 
 
431 aa  194  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.280518 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  29.79 
 
 
461 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2869  type I restriction-modification system, S subunit  28.02 
 
 
448 aa  177  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0947716  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  30.93 
 
 
428 aa  176  9e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1064  type I restriction-modification  28.85 
 
 
453 aa  175  2e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  8.98872e-06  normal  0.027841 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2200  type I restriction-modification system specificity subunit  29.93 
 
 
461 aa  173  4e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.844306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  32.14 
 
 
477 aa  173  6e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0416  type I restriction-modification system S subunit  30.16 
 
 
457 aa  170  4e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0531711 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0750  putative type I restriction-modification system  29.36 
 
 
436 aa  170  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.769779  normal  0.272821 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  28.38 
 
 
439 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  35.74 
 
 
453 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0193  type I restriction-modification system specificity determinant  26.06 
 
 
416 aa  166  6e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  30.93 
 
 
432 aa  166  1e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.93 
 
 
456 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1366  putative type I site-specific restriction-modification system, S subunit  28.94 
 
 
422 aa  160  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0493853  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  41.5 
 
 
477 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2607  restriction modification system DNA specificity subunit  30.11 
 
 
462 aa  157  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  27.31 
 
 
464 aa  157  5e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  33.33 
 
 
458 aa  156  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.37 
 
 
445 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  27.99 
 
 
429 aa  155  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4472  restriction modification system DNA specificity subunit  31.29 
 
 
415 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.270866  normal  0.0902542 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0796  restriction modification system DNA specificity domain  28.74 
 
 
441 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343889 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1860  type I restriction enzyme, S subunit  27.92 
 
 
474 aa  153  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0504746  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0640  restriction modification system DNA specificity subunit  28.88 
 
 
447 aa  150  6e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0277  hypothetical protein  26.26 
 
 
474 aa  149  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.46 
 
 
427 aa  149  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  25.11 
 
 
456 aa  146  7e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.2 
 
 
457 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2268  putative type I restriction enzyme, S subunit  26.37 
 
 
457 aa  143  5e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1783  restriction modification system DNA specificity subunit  27.59 
 
 
448 aa  141  2e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6260  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.19 
 
 
441 aa  141  2e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  28.05 
 
 
413 aa  141  2e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1516  restriction modification system DNA specificity subunit  26.05 
 
 
395 aa  140  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.205219 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  28.18 
 
 
429 aa  137  3e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3089  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.29 
 
 
520 aa  135  2e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  28.21 
 
 
425 aa  134  2e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2176  restriction modification system DNA specificity subunit  25.65 
 
 
444 aa  132  1e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.962317  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1221  restriction modification system DNA specificity subunit  24.43 
 
 
463 aa  131  2e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  28.35 
 
 
429 aa  131  2e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3571  hypothetical protein  25.62 
 
 
458 aa  132  2e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1366  hypothetical protein  26.76 
 
 
462 aa  131  2e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2688  restriction endonuclease S subunits-like  31.03 
 
 
487 aa  130  4e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.165356  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1027  restriction modification system DNA specificity subunit  40.62 
 
 
420 aa  129  8e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.76 
 
 
442 aa  128  2e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  26.09 
 
 
446 aa  126  9e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  41.14 
 
 
397 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  30.24 
 
 
419 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1481  restriction endonuclease S subunits-like protein  25.95 
 
 
443 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  33.01 
 
 
462 aa  124  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  29.38 
 
 
420 aa  124  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2698  restriction modification system DNA specificity subunit  31.85 
 
 
267 aa  123  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0854775  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  31.6 
 
 
456 aa  122  1e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2086  restriction modification system DNA specificity domain protein  41.88 
 
 
417 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.83293e-08 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0658  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.37 
 
 
473 aa  119  1e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0264  restriction modification system DNA specificity subunit  25.88 
 
 
407 aa  117  4e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3132  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.62 
 
 
424 aa  116  7e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.474681 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  28.35 
 
 
453 aa  115  2e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  24.83 
 
 
451 aa  114  4e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  27.85 
 
 
435 aa  112  2e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  1.59098e-06 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2682  putative restriction endonuclease S subunit  28.47 
 
 
400 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.845062  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3653  type I restriction enzyme StySPI specificity protein  25.97 
 
 
460 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234587  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3599  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.71 
 
 
532 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.743632  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5276  restriction modification system DNA specificity subunit  26.69 
 
 
418 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3267  restriction modification system DNA specificity subunit  31.91 
 
 
557 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0920403  decreased coverage  0.00535253 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  32.92 
 
 
438 aa  102  9e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2606  restriction modification system DNA specificity subunit  25.84 
 
 
429 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.45 
 
 
422 aa  94  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  33.89 
 
 
393 aa  93.6  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1805  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.85 
 
 
423 aa  93.2  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.745604  normal  0.535567 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0149  restriction modification system DNA specificity subunit  32.14 
 
 
400 aa  91.3  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1978  restriction modification system DNA specificity subunit  31.11 
 
 
616 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  31.77 
 
 
476 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  28.33 
 
 
285 aa  90.5  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  31.67 
 
 
402 aa  90.5  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  25.11 
 
 
435 aa  89.4  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0864  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.83 
 
 
413 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  25.37 
 
 
442 aa  89.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2277  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.78 
 
 
433 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  hitchhiker  6.77276e-06 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4454  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.41 
 
 
406 aa  87.8  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.859615  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  25.44 
 
 
426 aa  87  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0504  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.92 
 
 
408 aa  85.9  1e-15  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1551  type I restriction enzyme  24.4 
 
 
439 aa  85.5  2e-15  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  26.3 
 
 
417 aa  85.1  2e-15  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0132  restriction modification system DNA specificity subunit  25.31 
 
 
427 aa  84.7  3e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.47299 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  26.36 
 
 
409 aa  84  4e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20210  restriction modification system DNA specificity domain protein  30 
 
 
565 aa  83.2  8e-15  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266778  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22810  hypothetical protein  24.07 
 
 
418 aa  82.8  1e-14  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  25.87 
 
 
426 aa  82.8  1e-14  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  24.93 
 
 
430 aa  82  2e-14  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0227  restriction modification system DNA specificity domain  26.47 
 
 
395 aa  80.1  7e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  26.3 
 
 
374 aa  78.6  2e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1954  restriction modification system DNA specificity subunit  34.39 
 
 
406 aa  79  2e-13  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  26.34 
 
 
432 aa  77.8  3e-13  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  28.36 
 
 
846 aa  77.4  4e-13  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  28.98 
 
 
390 aa  77  6e-13  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  2.69296e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>