More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0673 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0748  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  99.73 
 
 
372 aa  761    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1354  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  98.12 
 
 
372 aa  752    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.401236  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0673  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  100 
 
 
372 aa  763    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0654  peptidoglycan-binding LysM:Lytic transglycosylase, catalytic (SLT family)  59.38 
 
 
383 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0645436  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0459  putative Signal recognition particle protein (Fifty-four-like protein)  45.48 
 
 
403 aa  316  4e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1987  Dyp-type peroxidase  43.4 
 
 
403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1191  regulatory protein dnir  42.93 
 
 
404 aa  306  4.0000000000000004e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0661  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 
415 aa  277  2e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.398223  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1082  lytic transglycosylase, catalytic  43.06 
 
 
379 aa  269  5e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  39.06 
 
 
733 aa  192  6e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  31.92 
 
 
620 aa  175  9e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  33.52 
 
 
544 aa  170  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0300  regulatory protein dnir  36.04 
 
 
321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.89505  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4010  lytic transglycosylase, catalytic  34.72 
 
 
507 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000241761  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1010  Slt family transglycosylase  34.15 
 
 
506 aa  162  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0489  Lytic transglycosylase catalytic  34.83 
 
 
487 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000573639 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  33 
 
 
547 aa  162  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0472  lytic transglycosylase catalytic protein  34.83 
 
 
484 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2556  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  32.09 
 
 
499 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000626959  hitchhiker  0.0000000459399 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  32.99 
 
 
618 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  33.92 
 
 
544 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.79 
 
 
617 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3789  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  30.34 
 
 
572 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3932  Lytic transglycosylase catalytic  30.75 
 
 
573 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  29.97 
 
 
638 aa  155  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3846  Lytic transglycosylase catalytic  30.75 
 
 
573 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2744  Lytic transglycosylase catalytic  31.07 
 
 
448 aa  155  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.42143e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  30.82 
 
 
587 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  35.13 
 
 
442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0695  Lytic transglycosylase catalytic  31.11 
 
 
499 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000410524  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  31.66 
 
 
495 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0305  Lytic transglycosylase catalytic  31.48 
 
 
440 aa  150  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0393  lytic transglycosylase, catalytic  31.43 
 
 
498 aa  149  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00582053  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  32.05 
 
 
595 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1895  Lytic transglycosylase catalytic  30.03 
 
 
693 aa  139  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  33.57 
 
 
498 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  30.38 
 
 
523 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3834  Lytic transglycosylase catalytic  28.8 
 
 
405 aa  136  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  35.43 
 
 
447 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  26.91 
 
 
498 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1043  lytic transglycosylase, catalytic  30.8 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0755702  hitchhiker  0.000682757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1334  Lytic transglycosylase catalytic  31.23 
 
 
451 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  29.36 
 
 
554 aa  133  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  31.8 
 
 
552 aa  132  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.25 
 
 
464 aa  132  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  29.45 
 
 
523 aa  132  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  28.12 
 
 
610 aa  130  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  33.56 
 
 
499 aa  129  7.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  33.56 
 
 
487 aa  129  7.000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  27.41 
 
 
527 aa  129  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  31.32 
 
 
518 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  31.65 
 
 
479 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1006  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.37 
 
 
465 aa  127  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.23 
 
 
543 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  31.35 
 
 
534 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.77 
 
 
515 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  31.65 
 
 
479 aa  126  6e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2686  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.11 
 
 
395 aa  126  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.83719  normal  0.0402839 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1105  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.11 
 
 
472 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1051  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.11 
 
 
459 aa  126  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.31 
 
 
457 aa  125  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.45 
 
 
457 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00204  predicted membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.38 
 
 
452 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00209  hypothetical protein  28.38 
 
 
452 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.133083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0215  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.38 
 
 
452 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00533886  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0908  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.06 
 
 
475 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3454  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.38 
 
 
452 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0216  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.38 
 
 
452 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.806422  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0225  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.38 
 
 
406 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459174  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0207  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.38 
 
 
452 aa  124  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0223  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.38 
 
 
406 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1205  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.2 
 
 
426 aa  123  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.627815  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  30.25 
 
 
534 aa  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  28.83 
 
 
539 aa  122  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.72 
 
 
530 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  28.89 
 
 
522 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  27.56 
 
 
650 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.48 
 
 
532 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  30.07 
 
 
445 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  31.36 
 
 
548 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  27.65 
 
 
476 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0486  lytic transglycosylase, catalytic  27.36 
 
 
419 aa  119  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.232763  normal  0.0521482 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  29.72 
 
 
553 aa  119  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4430  lytic transglycosylase like protein  29.1 
 
 
524 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408016  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2292  Lytic transglycosylase catalytic  29.37 
 
 
458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376038  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0077  Lytic transglycosylase catalytic  33.8 
 
 
322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  29.41 
 
 
517 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1137  Lytic transglycosylase catalytic  32.05 
 
 
304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000172741  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2032  lytic transglycosylase catalytic  29.6 
 
 
528 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277955  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.03 
 
 
527 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  28.33 
 
 
550 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  30.51 
 
 
518 aa  117  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1177  lytic transglycosylase catalytic  28.97 
 
 
529 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.00000000111267  normal  0.0154135 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1988  lytic transglycosylase, catalytic  30.04 
 
 
474 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49985  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  27.06 
 
 
596 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1666  peptidoglycan-binding protein LysM  29.01 
 
 
501 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  30.07 
 
 
503 aa  116  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  28.62 
 
 
511 aa  116  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1165  lytic transglycosylase, catalytic  28.97 
 
 
529 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000346061  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0592  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.11 
 
 
553 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>