More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0475 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0500  50S ribosomal protein L28  100 
 
 		 64 aa  129  9e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.146333  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0475  50S ribosomal protein L28  100 
 
 		 64 aa  129  9e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373803  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1489  50S ribosomal protein L28  96.88 
 
 		 64 aa  128  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1029  50S ribosomal protein L28  90.62 
 
 		 64 aa  123  7e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.605821  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0722  50S ribosomal protein L28  84.13 
 
 		 63 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1608  ribosomal protein L28  90 
 
 		 62 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1345  50S ribosomal protein L28  80.95 
 
 		 63 aa  110  5e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0971  50S ribosomal protein L28  82.26 
 
 		 63 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.560189  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1602  50S ribosomal protein L28  73.33 
 
 		 62 aa  93.6  7e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0770  ribosomal protein L28  65 
 
 		 63 aa  84.3  6e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3214  50S ribosomal protein L28  63.93 
 
 		 77 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0753  50S ribosomal protein L28  65.57 
 
 		 77 aa  82  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.542713 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1117  50S ribosomal protein L28  63.93 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0072  ribosomal protein L28  57.89 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3802  50S ribosomal protein L28  61.29 
 
 		 77 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1253  50S ribosomal protein L28  63.49 
 
 		 78 aa  79.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1282  50S ribosomal protein L28  60.66 
 
 		 77 aa  79.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.397873  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2433  50S ribosomal protein L28  61.02 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102764  normal  0.494456 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5365  50S ribosomal protein L28  59.02 
 
 		 77 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421212 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3384  50S ribosomal protein L28  59.02 
 
 		 77 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.237994 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2722  50S ribosomal protein L28  59.02 
 
 		 77 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.238973  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0312  50S ribosomal protein L28  62.3 
 
 		 78 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000118312  normal  0.224841 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2323  50S ribosomal protein L28  59.68 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837544 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2713  50S ribosomal protein L28  59.68 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3149  50S ribosomal protein L28  60.66 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.65679 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2445  50S ribosomal protein L28  59.68 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2733  50S ribosomal protein L28  59.68 
 
 		 77 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0817  50S ribosomal protein L28  59.02 
 
 		 77 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2870  50S ribosomal protein L28  59.68 
 
 		 77 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0696096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0671  50S ribosomal protein L28  62.71 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0158059  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3428  50S ribosomal protein L28  59.02 
 
 		 77 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0550772  normal  0.711167 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2589  50S ribosomal protein L28  60.66 
 
 		 78 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.155889 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0793  50S ribosomal protein L28  59.02 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0978  50S ribosomal protein L28  59.02 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1021  50S ribosomal protein L28  59.02 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241673  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2231  50S ribosomal protein L28  59.02 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2527  50S ribosomal protein L28  59.02 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1137  50S ribosomal protein L28  59.02 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5834  50S ribosomal protein L28  59.02 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.685508 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0780  50S ribosomal protein L28  59.02 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3180  50S ribosomal protein L28  59.02 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1891  50S ribosomal protein L28  59.02 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0983  50S ribosomal protein L28  59.02 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149835  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0584  50S ribosomal protein L28  59.02 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2549  50S ribosomal protein L28  59.02 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1757  50S ribosomal protein L28  57.38 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.991694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2502  50S ribosomal protein L28  59.02 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.553249  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2420  50S ribosomal protein L28  59.02 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.127484  hitchhiker  0.000900978 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2647  50S ribosomal protein L28  59.02 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753369  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2021  ribosomal protein L28  59.02 
 
 		 78 aa  74.7  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2100  50S ribosomal protein L28  59.02 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.295795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0089  ribosomal protein L28  55.56 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.376703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0224  50S ribosomal protein L28  55.56 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3424  50S ribosomal protein L28  62.71 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0875436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2515  50S ribosomal protein L28  61.02 
 
 		 73 aa  73.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0188  50S ribosomal protein L28  53.23 
 
 		 78 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000190685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3143  50S ribosomal protein L28  57.38 
 
 		 77 aa  73.6  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00769008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1734  50S ribosomal protein L28  59.02 
 
 		 77 aa  73.6  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.111139  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5282  50S ribosomal protein L28  53.23 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4374  50S ribosomal protein L28  53.23 
 
 		 78 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.335186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5333  50S ribosomal protein L28  53.23 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220339 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5537  50S ribosomal protein L28  53.23 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0793752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5192  50S ribosomal protein L28  53.23 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244386  normal  0.27276 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48050  50S ribosomal protein L28  53.23 
 
 		 78 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0726  50S ribosomal protein L28  56.67 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.140106  normal  0.323515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2016  50S ribosomal protein L28  56.67 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42169  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3114  50S ribosomal protein L28  56.67 
 
 		 96 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.878513  hitchhiker  0.00268781 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0325  ribosomal protein L28  56.45 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2583  50S ribosomal protein L28  62.71 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.273266  hitchhiker  0.000206552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6092  50S ribosomal protein L28  51.61 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3567  ribosomal protein L28  59.02 
 
 		 79 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1710  50S ribosomal protein L28  55.74 
 
 		 78 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2295  50S ribosomal protein L28  53.23 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0544676 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2670  50S ribosomal protein L28  53.23 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1989  50S ribosomal protein L28  55.74 
 
 		 78 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70190  50S ribosomal protein L28  51.61 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1452  50S ribosomal protein L28  57.38 
 
 		 77 aa  70.9  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.843962 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2139  ribosomal protein L28  55.74 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.476497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6556  ribosomal protein L28  57.38 
 
 		 79 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3480  50S ribosomal protein L28  53.23 
 
 		 78 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000307468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4560  50S ribosomal protein L28  57.14 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191213  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3074  50S ribosomal protein L28  53.33 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0386  50S ribosomal protein L28  57.14 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00127683  hitchhiker  0.000000115642 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0021  ribosomal protein L28  53.85 
 
 		 78 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0589  50S ribosomal protein L28  51.61 
 
 		 78 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.74438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3879  50S ribosomal protein L28  55 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0687874 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2640  ribosomal protein L28  54.84 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1918  ribosomal protein L28  50.82 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0055  ribosomal protein L28  53.23 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378886  normal  0.0544728 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3951  50S ribosomal protein L28  54.1 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3586  50S ribosomal protein L28  53.33 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18615 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1410  ribosomal protein L28  54.39 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2599  50S ribosomal protein L28  54.84 
 
 		 78 aa  67  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.88112e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0905  ribosomal protein L28  52.63 
 
 		 64 aa  67  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000028073  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3827  50S ribosomal protein L28  51.61 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.199336  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0918  50S ribosomal protein L28  51.67 
 
 		 99 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904068  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00055  ribosomal protein L28  53.23 
 
 		 78 aa  67  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000288614  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0191  50S ribosomal protein L28  54.84 
 
 		 78 aa  67  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000089275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3836  50S ribosomal protein L28  53.23 
 
 		 78 aa  67  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000849102  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0669  50S ribosomal protein L28  49.15 
 
 		 86 aa  67  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000239992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>