297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0391 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0391  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.914065  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0417  TetR family transcriptional regulator  98.57 
 
 		 210 aa  423  1e-117  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.582738  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1589  TetR family transcriptional regulator  95.71 
 
 		 210 aa  413  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1558  transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  36.59 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  31.75 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  32.51 
 
 		 209 aa  88.2  7e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1641  transcriptional regulator, TetR family protein  33.1 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.216203  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  26.46 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  25.52 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  24.62 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1167  regulatory protein TetR  32.74 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000201787  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0123  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  24.49 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  21.89 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  28.83 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3014  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  21.76 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  24.74 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  25.62 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  23 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  26.42 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  37.62 
 
 		 190 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24360  transcriptional regulator  30.11 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  24.53 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7041  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4287  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4114  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3955  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.915843  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3966  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4434  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4342  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4231  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>