299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE_tRNA-Gly-2 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.36527  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2253  tRNA-Gly  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1978  tRNA-Gly  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.82132  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2331  tRNA-Gly  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0152091  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0891  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  98.67 
 
 		 777 bp  141  3e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.101452  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1730  tRNA-Gly  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.873105  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1755  tRNA-Gly  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2165  tRNA-Gly  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2245  tRNA-Gly  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0739  tRNA-Gly  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.158339  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1545  tRNA-Gly  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0044  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00255441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0072  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0073  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611784  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1789  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.212776  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0031  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0005  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000151844  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0241  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0909  tRNA-Gly  96.05 
 
 		 78 bp  119  9e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1013  tRNA-Gly  96.05 
 
 		 76 bp  119  9e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0028  tRNA-Gly  96.05 
 
 		 76 bp  119  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0030  tRNA-Gly  96.05 
 
 		 76 bp  119  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000189578  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0042  tRNA-Gly  96.05 
 
 		 76 bp  119  9e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443767  normal  0.830121 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0017  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0031  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0675454  normal  0.168417 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0028  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.706726  normal  0.167752 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0020  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000165408  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0028  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000313605  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0025  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.404716  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0017  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000592681  hitchhiker  0.00000010486 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0035  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0213758  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0069  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.494624  hitchhiker  0.00109102 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0037  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0254902  normal  0.171485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0855  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0033  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0406258  normal  0.16961 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0029  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11864  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.611211  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0022  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t34  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.417453  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0051  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0500664 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0019  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00502278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0037  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.133837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0024  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0028  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.433481  normal  0.466553 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0044  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0043  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000132411  normal  0.194852 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1033  tRNA-Gly  96.83 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.573646  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0031  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000029648 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0046  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.098729  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0006  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0020  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286535 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0025  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0041  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0038  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148988  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0006  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000670589  normal  0.608185 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0010  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.695097  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGly02  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0007  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000264887  normal  0.61678 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0011  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.770603  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0050  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00165947  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0058  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0052  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.165358 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0040  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471615  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0015  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409791  hitchhiker  0.00133566 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0061  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.638683  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0024  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113773  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt08  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.711822  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt09  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745225  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0063  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0055  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.9646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0037  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0060  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.766632 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0054  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.290496  normal  0.747562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0045  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.471231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0004  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.54255  normal  0.0153905 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0005  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0060  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18005  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0014  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.854137  normal  0.0928806 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0042  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0059  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.07343  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0060  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312952  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0005  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118248  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0044  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.69312  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0046  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4576  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0052  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0007  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0959  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0046  tRNA-Gly  98.11 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0044  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.35893e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0083  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.37865e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt36  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt36  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA45  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000360899  normal  0.702683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA57  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256598  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA59  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0609929  normal  0.691703 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0021  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0839387  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0078  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67777  normal  0.517696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0045  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.0236363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>