More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1897 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1897  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 160 aa  323  4.0000000000000003e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0026  Holliday junction resolvase  99.38 
 
 		 160 aa  323  7e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580095  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2104  Holliday junction resolvase  96.88 
 
 		 160 aa  316  7.999999999999999e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1573  Holliday junction resolvase  88.54 
 
 		 158 aa  286  7e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2057  Holliday junction resolvase  87.9 
 
 		 157 aa  283  8e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1854  Holliday junction resolvase  85.35 
 
 		 157 aa  280  4.0000000000000003e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1822  Holliday junction resolvase  76.92 
 
 		 157 aa  259  1e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.21855  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0002  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  71.15 
 
 		 157 aa  239  9e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.075802  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1794  Holliday junction resolvase  71.61 
 
 		 158 aa  239  1e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.098383  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2104  Holliday junction resolvase  65.61 
 
 		 159 aa  214  4e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.38 
 
 		 191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.78 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  38.85 
 
 		 161 aa  110  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.78 
 
 		 191 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42 
 
 		 173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.67 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  39.07 
 
 		 180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  37.75 
 
 		 180 aa  107  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  39.07 
 
 		 180 aa  107  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  39.07 
 
 		 180 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2324  Holliday junction resolvase  36.71 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.747333  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  40.13 
 
 		 176 aa  107  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  38.16 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  38.16 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  38.16 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  37.91 
 
 		 284 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  38.16 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  37.91 
 
 		 275 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  40.25 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3491  Holliday junction resolvase  37.91 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  39.47 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0138  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.35 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  37.09 
 
 		 180 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 		 180 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  40.91 
 
 		 164 aa  104  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  37.75 
 
 		 180 aa  104  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  37.09 
 
 		 180 aa  104  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  37.09 
 
 		 180 aa  104  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  35.76 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  35.76 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0476  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.73 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  35.76 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  39.47 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0987  Holliday junction resolvase  36.84 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  42.11 
 
 		 171 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  37.66 
 
 		 183 aa  101  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  39.07 
 
 		 182 aa  101  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.84 
 
 		 166 aa  101  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0497  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.37 
 
 		 187 aa  100  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.655461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0539  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.37 
 
 		 187 aa  100  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.75 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.1 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1651  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.01 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.58 
 
 		 182 aa  99.4  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  39.33 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  39.33 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.31 
 
 		 191 aa  99.4  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.553379  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  40.37 
 
 		 172 aa  99  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  38.67 
 
 		 174 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  39.07 
 
 		 175 aa  99  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.23 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  36.49 
 
 		 173 aa  98.2  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  32.5 
 
 		 164 aa  97.4  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  34.64 
 
 		 173 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  37.84 
 
 		 173 aa  97.8  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  39.35 
 
 		 194 aa  97.1  9e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  39.35 
 
 		 194 aa  97.1  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.07 
 
 		 183 aa  97.1  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  33.33 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  37.42 
 
 		 162 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  39.63 
 
 		 180 aa  96.3  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.97 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0543  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.01 
 
 		 186 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  38.16 
 
 		 181 aa  95.5  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  35.48 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  36.6 
 
 		 181 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.16 
 
 		 176 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  37.25 
 
 		 181 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  39.22 
 
 		 181 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  36.67 
 
 		 174 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  36.67 
 
 		 174 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.97 
 
 		 162 aa  94.4  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4000  Holliday junction resolvase  39.33 
 
 		 174 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  36.67 
 
 		 174 aa  94  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3202  Holliday junction resolvase  37.67 
 
 		 197 aa  93.6  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0673445 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.67 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  35.95 
 
 		 181 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2236  Crossover junction endodeoxyribonuclease  33.59 
 
 		 179 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.97 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  37.09 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  37.21 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  37.21 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  35.06 
 
 		 182 aa  92.8  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0930  Holliday junction resolvase  36.36 
 
 		 182 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1846  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.23 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.018832  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  37.21 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  37.21 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2211  Holliday junction resolvase  36.92 
 
 		 167 aa  92  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  37.98 
 
 		 173 aa  92  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  37.21 
 
 		 173 aa  91.3  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>