More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1896 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_2103  flagellar hook protein FlgE  75.26 
 
 
875 aa  1259    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1896  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
845 aa  1707    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0107  flagellar hook protein FlgE  53.21 
 
 
814 aa  791    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000370744  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0025  flagellar hook protein FlgE  82.72 
 
 
838 aa  1383    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2040  flagellar hook protein FlgE  42.65 
 
 
819 aa  610  1e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1862  flagellar hook protein FlgE  43.55 
 
 
814 aa  605  1.0000000000000001e-171  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1769  flagellar hook protein FlgE  42.04 
 
 
911 aa  347  8e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2291  flagellar hook protein FlgE  39.41 
 
 
851 aa  317  4e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0032  flagellar hook protein FlgE  42.97 
 
 
718 aa  266  1e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0257  hypothetical protein  45.38 
 
 
623 aa  184  8.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0255  hypothetical protein  45 
 
 
750 aa  179  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  47.06 
 
 
488 aa  164  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  47.5 
 
 
519 aa  161  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000289081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  45.54 
 
 
440 aa  157  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1293  hypothetical protein  44.62 
 
 
705 aa  153  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  41.6 
 
 
428 aa  150  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  41.6 
 
 
428 aa  150  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  43.55 
 
 
442 aa  149  2.0000000000000003e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1537  hypothetical protein  44.09 
 
 
770 aa  148  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  44.06 
 
 
417 aa  147  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  45.11 
 
 
441 aa  147  8.000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  43.62 
 
 
475 aa  146  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  44.62 
 
 
463 aa  146  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  46.46 
 
 
454 aa  146  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  44.13 
 
 
398 aa  145  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1400  protein of unknown function DUF1078 domain protein  44.15 
 
 
508 aa  143  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.153228  normal  0.872762 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0108  hypothetical protein  42.33 
 
 
702 aa  142  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00280188  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  41.75 
 
 
394 aa  138  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.47 
 
 
415 aa  135  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2708  hypothetical protein  42.47 
 
 
479 aa  135  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  41.6 
 
 
428 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  49.23 
 
 
265 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.78 
 
 
390 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.16 
 
 
397 aa  131  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1328  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.47 
 
 
636 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1119  flagellar basal body rod protein FlgG  46.38 
 
 
264 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.33 
 
 
462 aa  129  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  35.08 
 
 
419 aa  128  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  48.2 
 
 
408 aa  127  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4124  protein of unknown function DUF1078 domain protein  47.13 
 
 
426 aa  127  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2339  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.54 
 
 
276 aa  124  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515219  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  35.2 
 
 
419 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  37.34 
 
 
405 aa  123  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0779  hypothetical protein  44.62 
 
 
275 aa  123  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000475542  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  33.98 
 
 
451 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  34.22 
 
 
461 aa  121  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  33.61 
 
 
401 aa  120  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  36.73 
 
 
405 aa  120  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  33.61 
 
 
401 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  33.89 
 
 
402 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  33.61 
 
 
401 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  33.89 
 
 
402 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1399  fagellar hook-basal body protein  45.03 
 
 
335 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1757  hypothetical protein  48.23 
 
 
310 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.1 
 
 
266 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.1 
 
 
266 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2400  hypothetical protein  47.45 
 
 
856 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  33.89 
 
 
402 aa  119  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  34.45 
 
 
399 aa  119  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  44.37 
 
 
564 aa  119  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  34.71 
 
 
399 aa  118  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  34.77 
 
 
437 aa  118  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  33.89 
 
 
402 aa  118  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  35.04 
 
 
405 aa  118  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  33.61 
 
 
401 aa  118  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1467  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.98 
 
 
584 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  46.48 
 
 
266 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  35.26 
 
 
409 aa  117  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  32.68 
 
 
433 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  31.91 
 
 
428 aa  117  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  35.1 
 
 
405 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  33.98 
 
 
437 aa  117  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  31.91 
 
 
428 aa  117  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  31.91 
 
 
428 aa  117  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1010  hypothetical protein  33.96 
 
 
556 aa  117  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0819939  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  33.33 
 
 
383 aa  117  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2210  ribonuclease III  32.96 
 
 
804 aa  115  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0246  protein of unknown function DUF1078 domain protein  46.38 
 
 
545 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0426476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4194  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.55 
 
 
260 aa  114  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  35.46 
 
 
417 aa  114  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.1 
 
 
260 aa  114  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2432  protein of unknown function DUF1078 domain protein  45.59 
 
 
562 aa  114  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  34.04 
 
 
398 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.48 
 
 
261 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3739  flagellar basal body rod protein FlgG  47.45 
 
 
261 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  33.06 
 
 
421 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24050  flagellar basal-body rod protein  44.6 
 
 
260 aa  112  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  44.2 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  38.92 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  44.2 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1105  hypothetical protein  32.82 
 
 
637 aa  112  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  44.2 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  36.13 
 
 
402 aa  111  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  36.13 
 
 
402 aa  111  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  36.78 
 
 
404 aa  111  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  42.96 
 
 
262 aa  111  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  47.1 
 
 
266 aa  111  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1147  flagellar basal-body rod protein FlgG  44.2 
 
 
262 aa  111  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000153607  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1614  protein of unknown function DUF1078 domain protein  46.32 
 
 
513 aa  111  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.621437  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  32.69 
 
 
442 aa  111  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>