36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1821 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1821  putative lipoprotein  100 
 
 
199 aa  394  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1640  putative lipoprotein  97.99 
 
 
199 aa  370  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2009  putative lipoprotein  97.99 
 
 
199 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0099  protein of unknown function DUF330  28.73 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0465  protein of unknown function DUF330  23.53 
 
 
206 aa  57.4  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  25.33 
 
 
398 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0521  protein of unknown function DUF330  18.04 
 
 
213 aa  55.1  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.67807  normal  0.409639 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  20.55 
 
 
247 aa  52.4  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  21.29 
 
 
378 aa  52.4  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  28.36 
 
 
204 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  24.79 
 
 
367 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  21.53 
 
 
214 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  21.53 
 
 
214 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  27.07 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0370  hypothetical protein  21.97 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  22.6 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  22.6 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  25.86 
 
 
369 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  25.2 
 
 
390 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  27.32 
 
 
203 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0120  conserved hypothetical lipoprotein  20.3 
 
 
197 aa  46.6  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77236  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3671  hypothetical protein  26.79 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1525  hypothetical protein  23.98 
 
 
198 aa  46.2  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00769355  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2804  protein of unknown function DUF330  27.43 
 
 
207 aa  45.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0375  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  17.24 
 
 
220 aa  44.7  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0820  protein of unknown function DUF330  21.74 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  26.34 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1678  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  22.37 
 
 
200 aa  43.9  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0139  putative lipoprotein  21.37 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0854  protein of unknown function DUF330  21.05 
 
 
207 aa  41.6  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251206  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4964  protein of unknown function DUF330  19.47 
 
 
200 aa  41.6  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0155  lipoprotein  22.54 
 
 
211 aa  42  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0894  hypothetical protein  21.05 
 
 
207 aa  41.6  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.749992 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2110  lipoprotein  19.83 
 
 
209 aa  41.6  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214262  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0157  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  21.37 
 
 
211 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  22.76 
 
 
390 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>