More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1796 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1796  L-serine ammonia-lyase  100 
 
 		 454 aa  936    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1984  L-serine ammonia-lyase  96.04 
 
 		 454 aa  885    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0085  L-serine dehydratase  75.72 
 
 		 455 aa  711    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1615  L-serine ammonia-lyase  99.78 
 
 		 454 aa  933    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.746998  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0608  L-serine dehydratase 1  47.67 
 
 		 476 aa  425  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000749  L-serine dehydratase  48.45 
 
 		 456 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360037  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04899  L-serine dehydratase  47.79 
 
 		 456 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1077  L-serine dehydratase  48.24 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04817  L-serine deaminase  47.45 
 
 		 456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2027  L-serine ammonia-lyase  46.32 
 
 		 454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02979  L-serine dehydratase 3  47.2 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1490  L-serine ammonia-lyase  46.32 
 
 		 454 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3408  L-serine ammonia-lyase TdcG  47.2 
 
 		 456 aa  403  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1305  L-serine ammonia-lyase  46.1 
 
 		 454 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0226237  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3586  L-serine dehydratase tdcG  47.2 
 
 		 454 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1970  L-serine ammonia-lyase  46.32 
 
 		 454 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.328671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3431  L-serine ammonia-lyase  45.99 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4425  L-serine ammonia-lyase TdcG  47.2 
 
 		 456 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305436 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0586  L-serine dehydratase 1  47.2 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1966  L-serine ammonia-lyase  46.1 
 
 		 454 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02930  hypothetical protein  47.2 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3300  L-serine ammonia-lyase  47.2 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3245  L-serine ammonia-lyase TdcG  47.2 
 
 		 454 aa  403  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.346654  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01784  L-serine deaminase I  45.67 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0591  L-serine dehydratase 1  46.98 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1829  L-serine dehydratase 1  45.67 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.693137  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3428  L-serine ammonia-lyase  46.2 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3598  L-serine ammonia-lyase  45.99 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.842995  normal  0.929959 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2075  L-serine ammonia-lyase 1  45.63 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2042  L-serine dehydratase 1  45.67 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01772  hypothetical protein  45.67 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1374  L-serine ammonia-lyase 1  45.67 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.779144  normal  0.0170145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2543  L-serine ammonia-lyase 1  45.67 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1819  L-serine dehydratase 1  45.67 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2019  L-serine dehydratase 1  43.98 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3256  L-serine dehydratase 1  46.56 
 
 		 456 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1904  L-serine dehydratase 1  45.67 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3535  L-serine ammonia-lyase  46.2 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1638  L-serine dehydratase  46.12 
 
 		 454 aa  396  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0329  L-serine dehydratase 1  46.3 
 
 		 463 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1928  L-serine dehydratase 1  45.92 
 
 		 454 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2383  L-serine ammonia-lyase  46.1 
 
 		 454 aa  398  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2223  L-serine dehydratase 1  45.92 
 
 		 454 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3502  L-serine ammonia-lyase  45.99 
 
 		 454 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2667  L-serine dehydratase 1  45.55 
 
 		 456 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0891  L-serine dehydratase 1  46.2 
 
 		 455 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0393995  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2355  L-serine ammonia-lyase  45.91 
 
 		 454 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.615532  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1985  L-serine dehydratase 1  44.2 
 
 		 453 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2451  L-serine dehydratase 1  45.91 
 
 		 454 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2940  L-serine dehydratase 1  45.81 
 
 		 455 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.544189  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02642  L-serine deaminase II  46.2 
 
 		 455 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02604  hypothetical protein  46.2 
 
 		 455 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3102  L-serine dehydratase 2  46.2 
 
 		 455 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0915  L-serine dehydratase 1  46.2 
 
 		 455 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2941  L-serine ammonia-lyase  46.2 
 
 		 455 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.73805  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1241  L-serine dehydratase 1  45.41 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.341866  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6246  L-serine dehydratase 1  44.49 
 
 		 455 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3075  L-serine ammonia-lyase 2  46.2 
 
 		 455 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260671  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4061  L-serine ammonia-lyase 2  46.2 
 
 		 455 aa  388  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2937  L-serine ammonia-lyase 2  46.2 
 
 		 455 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.427341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01684  L-serine ammonia-lyase  45 
 
 		 468 aa  386  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.737007  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0052  L-serine ammonia-lyase  45.55 
 
 		 462 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02760  L-serine ammonia-lyase  44.11 
 
 		 472 aa  385  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4547  L-serine ammonia-lyase  46.29 
 
 		 462 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2810  L-serine dehydratase 1  44.59 
 
 		 461 aa  388  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  46.6 
 
 		 463 aa  388  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3250  L-serine dehydratase 1  45.36 
 
 		 455 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.648772  normal  0.619841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1629  L-serine dehydratase 1  45.85 
 
 		 455 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.815804  hitchhiker  0.00237889 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3591  L-serine dehydratase 1  43.04 
 
 		 475 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0897  L-serine dehydratase 1  44.47 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266509  normal  0.482369 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0918  L-serine dehydratase 1  44.95 
 
 		 453 aa  383  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000189103  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16840  L-serine ammonia-lyase  44.42 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128912  normal  0.527215 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3700  L-serine ammonia-lyase  44.08 
 
 		 457 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0772  L-serine dehydratase 1  44.87 
 
 		 455 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3884  L-serine dehydratase 1  45.34 
 
 		 462 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0112  L-serine dehydratase 1  43.89 
 
 		 462 aa  381  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0854  hypothetical protein  45.32 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0828  hypothetical protein  45.32 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0361  L-serine ammonia-lyase  46.94 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.739457  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1149  L-serine dehydratase 1  43.67 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003155  L-serine dehydratase  44.44 
 
 		 453 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.225865  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4369  L-serine ammonia-lyase  46.12 
 
 		 464 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0215032  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01908  L-serine dehydratase 1  44.92 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33030  L-serine dehydratase  44.86 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518916  hitchhiker  0.000319155 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0095  L-serine ammonia-lyase  43.89 
 
 		 462 aa  381  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0740  L-serine dehydratase 1  43.7 
 
 		 455 aa  376  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0859  L-serine ammonia-lyase  44.4 
 
 		 455 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4393  L-serine ammonia-lyase  44.86 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26040  L-serine dehydratase  45.3 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2808  L-serine dehydratase  44.86 
 
 		 469 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255142  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1343  L-serine dehydratase 1  44.28 
 
 		 453 aa  375  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2005  L-serine dehydratase 1  46.72 
 
 		 459 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.233439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3194  L-serine ammonia-lyase  45.14 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.500891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2570  L-serine dehydratase 1  43.2 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3179  L-serine ammonia-lyase  45.14 
 
 		 455 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.434034 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3131  L-serine ammonia-lyase  45.14 
 
 		 455 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1195  L-serine dehydratase 1  46.1 
 
 		 477 aa  373  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.197277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2913  L-serine dehydratase 1  46.2 
 
 		 462 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0155  L-serine dehydratase 1  46.2 
 
 		 462 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2711  L-serine dehydratase 1  44.08 
 
 		 458 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.468733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>