More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1724 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  100 
 
 		 494 aa  996    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  54.62 
 
 		 492 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0228  N-6 DNA methylase  43.65 
 
 		 484 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1577  type I restriction-modification system, M subunit  43.65 
 
 		 484 aa  411  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  44.35 
 
 		 486 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0807  DNA-methyltransferase, type I restriction-modification enzyme subunit M  42.74 
 
 		 486 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.444408  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1634  N-6 DNA methylase  41.46 
 
 		 495 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2651  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  42.21 
 
 		 484 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0553747  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0613  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  41.6 
 
 		 484 aa  393  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3570  N-6 DNA methylase  41.19 
 
 		 484 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.054861  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2087  N-6 DNA methylase  39.88 
 
 		 509 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122296 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0734  N-6 DNA methylase  37.92 
 
 		 534 aa  342  8e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.303269  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  37.06 
 
 		 503 aa  329  8e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  37.84 
 
 		 490 aa  320  3e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  36.27 
 
 		 519 aa  318  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5277  N-6 DNA methylase  39.06 
 
 		 571 aa  314  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  37.43 
 
 		 484 aa  310  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  33.73 
 
 		 710 aa  306  6e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  36.22 
 
 		 489 aa  300  4e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  33.8 
 
 		 703 aa  296  7e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  35.9 
 
 		 489 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  33.6 
 
 		 477 aa  292  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  36.22 
 
 		 490 aa  291  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  35.76 
 
 		 481 aa  289  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  34.76 
 
 		 488 aa  286  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  34.84 
 
 		 489 aa  286  5.999999999999999e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  33.99 
 
 		 484 aa  286  5.999999999999999e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  35.63 
 
 		 489 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  35.19 
 
 		 501 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  35.26 
 
 		 488 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  35.64 
 
 		 493 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  34.86 
 
 		 493 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  34.84 
 
 		 489 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  33.79 
 
 		 489 aa  283  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  34.13 
 
 		 481 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  34.66 
 
 		 489 aa  280  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  34.66 
 
 		 489 aa  280  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  35.57 
 
 		 493 aa  280  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  33.86 
 
 		 492 aa  280  5e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  36.8 
 
 		 500 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  35.27 
 
 		 479 aa  276  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  33.53 
 
 		 481 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  33.79 
 
 		 500 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  31.87 
 
 		 489 aa  266  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  32.39 
 
 		 502 aa  263  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1016  N-6 DNA methylase  33.53 
 
 		 485 aa  260  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  31.68 
 
 		 517 aa  214  3.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  29.44 
 
 		 505 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  33.08 
 
 		 499 aa  210  4e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  32.88 
 
 		 504 aa  210  5e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  32.65 
 
 		 545 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  31.82 
 
 		 508 aa  201  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  31.13 
 
 		 506 aa  201  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  28.4 
 
 		 570 aa  201  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  30.16 
 
 		 553 aa  200  6e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  31.93 
 
 		 527 aa  200  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  29.96 
 
 		 553 aa  199  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  29.53 
 
 		 554 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  29.49 
 
 		 489 aa  197  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  29.11 
 
 		 513 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1026  N-6 DNA methylase  30.6 
 
 		 549 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  31.56 
 
 		 484 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  29.84 
 
 		 506 aa  194  3e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  35.48 
 
 		 1005 aa  193  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  30.87 
 
 		 480 aa  190  5.999999999999999e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1673  N-6 DNA methylase  30.16 
 
 		 493 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  28.39 
 
 		 513 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  31.34 
 
 		 544 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  31.34 
 
 		 544 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  32.31 
 
 		 481 aa  181  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1992  N-6 DNA methylase  30.93 
 
 		 479 aa  179  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0409108  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  29.46 
 
 		 544 aa  180  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  27.59 
 
 		 579 aa  179  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  32.39 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3011  N-6 DNA methylase  33.01 
 
 		 563 aa  175  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.467528  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  31.88 
 
 		 834 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3181  N-6 DNA methylase  29.14 
 
 		 512 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  28.6 
 
 		 540 aa  172  9e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0857  N-6 DNA methylase  30 
 
 		 495 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.015495  normal  0.121553 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3541  N-6 DNA methylase  30.54 
 
 		 524 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0084  N-6 DNA methylase  29.29 
 
 		 495 aa  171  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2961  N-6 DNA methylase  31 
 
 		 530 aa  171  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  31.3 
 
 		 477 aa  170  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0031  N-6 DNA methylase  30.13 
 
 		 539 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.775177  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3652  N-6 DNA methylase  28.83 
 
 		 489 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.729594 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3672  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.18 
 
 		 533 aa  168  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0389  N-6 DNA methylase  29.84 
 
 		 818 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2413  N-6 DNA methylase  29.74 
 
 		 494 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  26.49 
 
 		 481 aa  164  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0844  type I restriction enzyme EcoKI M protein  28.66 
 
 		 484 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14895e-23 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03611  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  28.47 
 
 		 548 aa  162  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04215  DNA methylase M  30.27 
 
 		 529 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0841  type I restriction-modification system, M subunit  28 
 
 		 484 aa  161  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4931  type I restriction enzyme EcoKI M protein  28.86 
 
 		 529 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04181  hypothetical protein  30.27 
 
 		 529 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  38.34 
 
 		 775 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1096  N-6 DNA methylase  28.87 
 
 		 486 aa  160  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4265  type I restriction-modification system, M subunit  31.92 
 
 		 537 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  35.66 
 
 		 846 aa  158  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3269  type I restriction-modification system specificity subunit  31.61 
 
 		 498 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.266741  normal  0.0966647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>