225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1712 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 255 aa  517  1e-146  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  99.61 
 
 		 255 aa  513  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  97.65 
 
 		 255 aa  504  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  58.27 
 
 		 256 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  54.72 
 
 		 255 aa  300  2e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  52.99 
 
 		 254 aa  285  4e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  54.18 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  54.58 
 
 		 254 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  53.39 
 
 		 253 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  53.78 
 
 		 253 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  53.78 
 
 		 253 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  54.58 
 
 		 253 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  53.78 
 
 		 253 aa  280  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  53.78 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  51.79 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  53.78 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  53.39 
 
 		 253 aa  278  5e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  50.79 
 
 		 258 aa  275  6e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  54 
 
 		 252 aa  271  6e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  54.8 
 
 		 250 aa  271  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  54.8 
 
 		 250 aa  271  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  48.03 
 
 		 257 aa  267  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  49.8 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  49.2 
 
 		 252 aa  261  8e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 256 aa  258  8e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  44.94 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  47.6 
 
 		 253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  45.06 
 
 		 274 aa  248  6e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  47.18 
 
 		 254 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  45.38 
 
 		 255 aa  248  8e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 		 256 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  47.2 
 
 		 254 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  45.85 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  45.02 
 
 		 257 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  47.79 
 
 		 255 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  46.99 
 
 		 254 aa  238  5e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  45.85 
 
 		 260 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  46.59 
 
 		 246 aa  238  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  42.4 
 
 		 252 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  44.72 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6367  hypothetical protein  49.58 
 
 		 254 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0512992  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  45.6 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  45.97 
 
 		 254 aa  234  7e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  44.35 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  43.14 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0064  LamB/YcsF family protein  45.78 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2026  LamB/YcsF family protein  43.72 
 
 		 256 aa  233  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0388826 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  46.83 
 
 		 256 aa  231  6e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  43.87 
 
 		 251 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  43.14 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2372  LamB/YcsF family protein  43.6 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.839401 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  45.82 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1829  LamB/YcsF family protein  48.12 
 
 		 242 aa  229  3e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1972  LamB/YcsF family protein  43.2 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  45.08 
 
 		 254 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  48.89 
 
 		 258 aa  228  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  43.6 
 
 		 250 aa  228  6e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05397  hypothetical protein  42.06 
 
 		 260 aa  228  8e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.491165 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  45.1 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  41.77 
 
 		 255 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  42.17 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  43.31 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  43.08 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1958  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.289074  hitchhiker  0.00226482 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  42.57 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  42.51 
 
 		 256 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  42.57 
 
 		 256 aa  225  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2788  LamB/YcsF family protein  47.18 
 
 		 251 aa  224  9e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5650  LamB/YcsF family protein  39.37 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1341  LamB/YcsF family protein  38.58 
 
 		 255 aa  222  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2169  LamB/YcsF family protein  43.2 
 
 		 247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  42.8 
 
 		 254 aa  221  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  44.54 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  44.18 
 
 		 250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  44.18 
 
 		 250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0728  LamB/YcsF family protein  43.78 
 
 		 244 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.45791 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1029  LamB/YcsF family protein  42.62 
 
 		 250 aa  219  5e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  44.4 
 
 		 260 aa  218  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1257  LamB/YcsF family protein  42.51 
 
 		 245 aa  218  7.999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.187621  normal  0.809316 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  44.22 
 
 		 255 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  43.78 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  43.7 
 
 		 262 aa  216  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1117  LamB/YcsF family protein  41.77 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000433292  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3591  LamB/YcsF family protein  41.77 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3877  LamB/YcsF family protein  42.26 
 
 		 259 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.441072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1169  LamB/YcsF family protein  41.77 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000136688  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  44.62 
 
 		 252 aa  215  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4098  LamB/YcsF family protein  42.5 
 
 		 259 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  42.91 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  42.91 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  42.91 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00673  hypothetical protein  42.97 
 
 		 244 aa  214  7e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00662  hypothetical protein  42.97 
 
 		 244 aa  214  7e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2942  LamB/YcsF family protein  42.97 
 
 		 244 aa  214  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  44.21 
 
 		 252 aa  215  7e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  40.56 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1405  LamB/YcsF family protein  40.08 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  42.57 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0738  LamB/YcsF family protein  42.57 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0761  LamB/YcsF family protein  42.57 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>