More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1664 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  100 
 
 
226 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  95.58 
 
 
226 aa  431  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  94.69 
 
 
226 aa  428  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  62.67 
 
 
226 aa  288  7e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  58.74 
 
 
227 aa  271  5.000000000000001e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  56.62 
 
 
226 aa  252  3e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  54.63 
 
 
225 aa  242  3.9999999999999997e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1242  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 
227 aa  154  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.546498  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  38.29 
 
 
228 aa  137  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0736  response regulator receiver  32.41 
 
 
236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0448  response regulator receiver  31.46 
 
 
224 aa  128  7.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000838603  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0705  response regulator receiver  30.09 
 
 
231 aa  125  7e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00025775  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  32.59 
 
 
230 aa  124  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1991  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.656084  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  32.89 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0892  response regulator receiver  33.77 
 
 
233 aa  114  7.999999999999999e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1144  two component transcriptional regulator  33.49 
 
 
225 aa  114  7.999999999999999e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.77 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0837  two component transcriptional regulator  31.49 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  32.27 
 
 
229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  31.06 
 
 
231 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2122  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.85 
 
 
953 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0111685  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1224  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.98 
 
 
227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117785  hitchhiker  0.00926138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 
517 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 
502 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0005  response regulator receiver domain-containing protein  33.02 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0566865  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0749  two component transcriptional regulator  32.11 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0884  two component transcriptional regulator  28.24 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68851  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  30.64 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  30.64 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  31.86 
 
 
230 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2096  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.13 
 
 
953 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000903564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  30.21 
 
 
231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  33.64 
 
 
225 aa  107  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  31.86 
 
 
230 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  31.92 
 
 
220 aa  107  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  29.18 
 
 
230 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0685  response regulator receiver  26.55 
 
 
236 aa  106  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  32.59 
 
 
223 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  30.57 
 
 
239 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  30.57 
 
 
243 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  32.59 
 
 
223 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  32.84 
 
 
229 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1547  cytochrome c biogenesis protein  30.33 
 
 
220 aa  105  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0873939  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0625  two component transcriptional regulator  32.09 
 
 
217 aa  105  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2186  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 
381 aa  105  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000654459  hitchhiker  0.000162526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  32.35 
 
 
229 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01810  transcriptional regulatory protein  33.94 
 
 
226 aa  105  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  32.59 
 
 
223 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  32.59 
 
 
223 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  32.59 
 
 
223 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  32.59 
 
 
223 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  32.59 
 
 
223 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  32.59 
 
 
223 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  31.96 
 
 
229 aa  104  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1458  two component transcriptional regulator  29.91 
 
 
218 aa  104  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2098  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
547 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000413163 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  32.59 
 
 
223 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0059  two component transcriptional regulator  27.48 
 
 
229 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000152099 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 
223 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  31.58 
 
 
230 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.03 
 
 
227 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  32 
 
 
233 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  29.86 
 
 
221 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.89 
 
 
227 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 
547 aa  102  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 
227 aa  102  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.14 
 
 
232 aa  101  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
636 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0053  two component transcriptional regulator  27.48 
 
 
229 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000176822 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.11 
 
 
425 aa  101  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.141244  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  28.63 
 
 
241 aa  101  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  28.37 
 
 
219 aa  101  8e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  32.88 
 
 
220 aa  101  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  30.64 
 
 
234 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0964  two component transcriptional regulator  30.6 
 
 
258 aa  101  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.412408  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  28.38 
 
 
230 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5352  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.91 
 
 
224 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  30.84 
 
 
232 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  31.3 
 
 
229 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1516  two component transcriptional regulator  31.63 
 
 
218 aa  100  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346089  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0051  two component transcriptional regulator  27.03 
 
 
229 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030378 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0176  two component transcriptional regulator  29.73 
 
 
226 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  29.86 
 
 
221 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  31.56 
 
 
233 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.51 
 
 
224 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.07 
 
 
219 aa  99.8  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00404304  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.26 
 
 
234 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  32 
 
 
233 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  31.56 
 
 
233 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  32 
 
 
233 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0051  two component transcriptional regulator  27.93 
 
 
229 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  28.96 
 
 
244 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  32 
 
 
233 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0247  two component transcriptional regulator  29.96 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  27.68 
 
 
227 aa  99.8  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.28 
 
 
438 aa  99.8  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  27.73 
 
 
227 aa  99.4  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3617  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 
221 aa  99.4  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  30.84 
 
 
219 aa  99.4  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>