90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1517 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1517  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 
388 aa  786    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0381  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  95.09 
 
 
396 aa  746    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0384  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  54.87 
 
 
395 aa  423  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0597  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  51.3 
 
 
387 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1234  flagellin modification protein PtmD, putative UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  51.3 
 
 
390 aa  384  1e-105  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000000498244  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2302  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  48.56 
 
 
386 aa  372  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3122  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  45.71 
 
 
389 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2978  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  45.71 
 
 
389 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0528  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  42.71 
 
 
387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00671  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  43.9 
 
 
387 aa  335  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16940  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  45.08 
 
 
393 aa  331  1e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0630  UDP-N-acetyl-D-glucosamine 2-epimerase, UDP-hydrolysing  39.06 
 
 
392 aa  327  3e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2332  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  43.9 
 
 
388 aa  323  3e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.317223  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2640  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  44.26 
 
 
391 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001801  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  43.58 
 
 
392 aa  312  6.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4085  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  40.87 
 
 
385 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0170  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  41.67 
 
 
394 aa  312  7.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0253  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  41.67 
 
 
394 aa  312  7.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1971  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  38.74 
 
 
384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1457  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  38.38 
 
 
407 aa  297  2e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12441  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  41.45 
 
 
393 aa  295  6e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.706059  hitchhiker  0.00693738 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0048  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  38.8 
 
 
392 aa  293  5e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3099  putative NeuC  38.48 
 
 
387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2591  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  35.42 
 
 
387 aa  269  5e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457197  hitchhiker  0.0014233 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0368  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  36.63 
 
 
387 aa  267  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2398  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  35.29 
 
 
409 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3982  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  34.55 
 
 
394 aa  256  7e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0755  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  36.5 
 
 
400 aa  245  8e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.585499 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1587  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  37.05 
 
 
369 aa  243  3e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1160  UDP-N-acetylglucosamine-2-epimerase NeuC  36.69 
 
 
384 aa  241  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0149  UDP-N-acetyl-D-glucosamine 2-epimerase, UDP-hydrolysing  35 
 
 
388 aa  236  6e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3230  polysialic acid capsule biosynthesis protein NeuC  35.57 
 
 
391 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3013  polysialic acid biosynthesis protein P7  36.34 
 
 
388 aa  221  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14071  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  36.51 
 
 
370 aa  206  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01091  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  33.64 
 
 
386 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0790  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.78 
 
 
377 aa  201  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4855  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  29.17 
 
 
386 aa  200  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0819  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.74 
 
 
377 aa  199  5e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1575  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  29.78 
 
 
380 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.172735  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1461  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  28.16 
 
 
385 aa  192  6e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.303691  normal  0.741462 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0018  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  32.05 
 
 
382 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1159  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  36.67 
 
 
374 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000518956  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0423  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  34.73 
 
 
390 aa  187  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1535  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  29.85 
 
 
385 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1584  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  30.79 
 
 
385 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.373673  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0504  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  31.37 
 
 
371 aa  179  8e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.481831  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1846  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  29.82 
 
 
408 aa  170  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0561  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  30.41 
 
 
384 aa  170  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3364  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  29.85 
 
 
381 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0304  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  30.54 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.197458  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3255  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  28.03 
 
 
389 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08731  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  32.52 
 
 
373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.572404  hitchhiker  0.00000175685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4333  UDP-N-acetyl-D-glucosamine 2-epimerase, UDP- hydrolysing  28.4 
 
 
385 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.231513  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0396  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  20.89 
 
 
367 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0526893 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3733  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  20.95 
 
 
369 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647438  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3330  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  20.87 
 
 
362 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4822  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  19.35 
 
 
374 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08581  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  21.84 
 
 
370 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000168245 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4321  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  21.59 
 
 
367 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3697  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  21.6 
 
 
369 aa  53.5  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2775  UDP-N-acetyl glucosamine -2-epimerase  19.54 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.387027  normal  0.262996 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0648  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  19.42 
 
 
384 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711983  normal  0.178504 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2626  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  19.06 
 
 
407 aa  50.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1583  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  24.93 
 
 
363 aa  50.1  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.704524  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2378  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  21.75 
 
 
363 aa  49.7  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0429  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  23.35 
 
 
370 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0122439  normal  0.0635336 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0485  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  24.22 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00689  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  23.01 
 
 
374 aa  47.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1717  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  19.73 
 
 
381 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.632952  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0574  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  25.11 
 
 
364 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0381  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  22.4 
 
 
420 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213413  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1086  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  21.22 
 
 
376 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_25793  predicted protein  25.47 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000177629  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3850  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  19.65 
 
 
372 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275001  normal  0.265812 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1811  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  19.38 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1841  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  21.1 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000516167 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0150  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  21.69 
 
 
381 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0155  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  21.69 
 
 
381 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5359  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  21.07 
 
 
371 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5509  udp-n-acetylglucosamine 2-epimerase  21.07 
 
 
371 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000138875  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5117  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  21.07 
 
 
371 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0514  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  21.27 
 
 
376 aa  44.3  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1389  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  22.01 
 
 
373 aa  44.3  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3253  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  25.33 
 
 
352 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2387  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  20.51 
 
 
391 aa  43.5  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0541306 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1976  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  20.73 
 
 
380 aa  43.5  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0184  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  21.27 
 
 
376 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0259  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  22.26 
 
 
371 aa  43.5  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0160  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  19.92 
 
 
375 aa  43.5  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4031  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  21.27 
 
 
376 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.898267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>