26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1440 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1440  signal peptidase I, putative  100 
 
 
220 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  45.57 
 
 
244 aa  142  3e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  46.1 
 
 
239 aa  142  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0316  putative phage repressor protein  44.3 
 
 
244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00907838  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  29.37 
 
 
233 aa  58.5  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  24.17 
 
 
219 aa  55.8  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  34.91 
 
 
216 aa  55.5  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  29.55 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  25.79 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  32.08 
 
 
205 aa  52.8  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  29.53 
 
 
210 aa  52.4  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  24.89 
 
 
235 aa  51.6  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  28.87 
 
 
230 aa  48.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  28.83 
 
 
219 aa  47  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  25.36 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  22.13 
 
 
212 aa  46.2  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0215  phage repressor protein, putative  30.95 
 
 
209 aa  45.4  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0406422  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  22.73 
 
 
225 aa  45.1  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  24.03 
 
 
265 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  34.52 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  34.52 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  22.45 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  25.81 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  32.14 
 
 
240 aa  42.4  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  27.85 
 
 
214 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1991  putative phage repressor  26.72 
 
 
289 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000855833  hitchhiker  0.0000527672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>