107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0954 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0954  thiol:disulfide interchange protein DsbA, putative  100 
 
 
223 aa  454  1e-127  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0883  thiol:disulfide interchange protein DsbA, putative  97.31 
 
 
223 aa  440  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1021  putative thiol:disulfide interchange protein DsbA  97.31 
 
 
223 aa  442  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00252175  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbA  47.73 
 
 
220 aa  203  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.325546  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0951  thiol:disulfide interchange protein DsbA  47.73 
 
 
220 aa  202  3e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0559  thiol:disulfide interchange protein, DsbA family  51.08 
 
 
216 aa  202  4e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1013  thiol:disulfide interchange protein DsbA  45.91 
 
 
220 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000248495  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1665  disulfide isomerase  27.35 
 
 
223 aa  107  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1438  DSBA oxidoreductase  29.67 
 
 
220 aa  95.5  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.44353 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1380  DSBA oxidoreductase  29.47 
 
 
221 aa  95.1  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172007  normal  0.0174557 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3334  DsbA family thioredoxin  29.52 
 
 
222 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0002  integrase/recombinase  29.05 
 
 
218 aa  92.4  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000442871  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2110  hypothetical protein  32.72 
 
 
213 aa  91.3  9e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1147  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.96 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0433  disulfide isomerase  31.19 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.529354  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3379  disulfide isomerase  28.12 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.996727 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3451  disulfide isomerase  28.12 
 
 
223 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3444  disulfide isomerase  28.12 
 
 
223 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.923354  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3374  disulfide isomerase  28.12 
 
 
223 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3546  disulfide isomerase  28.12 
 
 
223 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.504028 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0856  disulfide isomerase  30.89 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4028  DSBA oxidoreductase  28.89 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0234  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  25 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4023  DSBA oxidoreductase  28.18 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3871  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  25.42 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  27.89 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  28.72 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3999  putative disulfide isomerase  30.32 
 
 
200 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.136528 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  28.27 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  25.41 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  26.18 
 
 
203 aa  60.1  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  23.45 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  23.45 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  25.89 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  23.45 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  23.45 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  23.45 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  23.45 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  23.45 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  23.45 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  23.45 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  24.86 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  24.86 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.31 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  24.87 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  24.87 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  24.87 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  23.66 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  23.66 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  23.66 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  23.66 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  23.66 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  24.87 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  23.81 
 
 
205 aa  52.8  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  23.68 
 
 
203 aa  51.6  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  25.96 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.11 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  23.78 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0898  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  21.96 
 
 
225 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  28.27 
 
 
212 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  22.94 
 
 
202 aa  49.7  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  22.32 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.79 
 
 
204 aa  48.9  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  25.48 
 
 
210 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1684  DSBA oxidoreductase  28.25 
 
 
215 aa  48.9  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0557  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.78 
 
 
213 aa  48.5  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  23.85 
 
 
216 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.51 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  24.61 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0135  DSBA oxidoreductase  25.93 
 
 
218 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.61 
 
 
212 aa  46.2  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.47 
 
 
223 aa  46.2  0.0004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  25.93 
 
 
218 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.13 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  25.13 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.13 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.13 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.13 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  25.13 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.13 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  25.65 
 
 
212 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  21.78 
 
 
207 aa  45.4  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  23.96 
 
 
211 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  21.24 
 
 
207 aa  45.1  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  21.24 
 
 
207 aa  45.1  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  21.24 
 
 
207 aa  45.1  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  22.32 
 
 
207 aa  45.1  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  22.32 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.23 
 
 
211 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  25.65 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.74 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  25.84 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  25.65 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  25.65 
 
 
212 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  26.88 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4888  hypothetical protein  21.84 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826795 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  26.23 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09722  DSBA oxidoreductase  26.4 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.412545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>