236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0937 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  100 
 
 
395 aa  767    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0999  major facilitator family protein  98.23 
 
 
395 aa  761    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.329257  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  98.23 
 
 
395 aa  759    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  60.61 
 
 
398 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  51.95 
 
 
414 aa  412  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  51.03 
 
 
412 aa  409  1e-113  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1179  transmembrane transport protein  50.75 
 
 
407 aa  404  1e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  30.51 
 
 
409 aa  169  8e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  29.03 
 
 
412 aa  164  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
436 aa  160  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  30.08 
 
 
431 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  30.7 
 
 
430 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  28.14 
 
 
438 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  27.93 
 
 
444 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  30.77 
 
 
415 aa  152  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  29.17 
 
 
425 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 
417 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  27.66 
 
 
438 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  28.57 
 
 
459 aa  150  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  29.56 
 
 
520 aa  149  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 
454 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  27.82 
 
 
428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  29.53 
 
 
432 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  27.66 
 
 
474 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  30.62 
 
 
427 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  30.25 
 
 
447 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  32.17 
 
 
471 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  28.19 
 
 
418 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  27.96 
 
 
411 aa  142  9e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  27.5 
 
 
452 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  26.95 
 
 
444 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  27.11 
 
 
429 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  30.56 
 
 
429 aa  140  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  27.75 
 
 
465 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  27.75 
 
 
473 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  27.3 
 
 
418 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  27.3 
 
 
418 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  29.21 
 
 
436 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  27.81 
 
 
397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  26.89 
 
 
417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  30.36 
 
 
446 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  29.62 
 
 
429 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  27.57 
 
 
416 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  28.41 
 
 
443 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  28.46 
 
 
411 aa  133  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  28.41 
 
 
481 aa  133  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  27.4 
 
 
443 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  26.46 
 
 
418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  26.46 
 
 
418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  27.12 
 
 
444 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 
430 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  27.12 
 
 
446 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  27.45 
 
 
436 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  28.03 
 
 
429 aa  129  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 
480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  28.53 
 
 
474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  27.84 
 
 
480 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  27.84 
 
 
480 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  27.97 
 
 
474 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  26.33 
 
 
446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  26.33 
 
 
446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  27.84 
 
 
480 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  26.33 
 
 
446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  26.91 
 
 
447 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  27.35 
 
 
476 aa  126  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  27.35 
 
 
476 aa  126  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  28.28 
 
 
424 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  29.55 
 
 
427 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  26.72 
 
 
471 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  28.98 
 
 
433 aa  123  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  27.58 
 
 
411 aa  123  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  27.22 
 
 
408 aa  122  9e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  27.32 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  27.1 
 
 
464 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  28.24 
 
 
421 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  26.91 
 
 
412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  25.9 
 
 
385 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  25.94 
 
 
412 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0467  major facilitator transporter  27.51 
 
 
439 aa  119  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.677382 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  27.19 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  24.56 
 
 
434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  24.56 
 
 
434 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  29.03 
 
 
420 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  28.48 
 
 
443 aa  113  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  25.44 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  29.97 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  23.49 
 
 
410 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
432 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  26.82 
 
 
713 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  27.7 
 
 
381 aa  107  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.289125 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3325  major facilitator transporter  26.63 
 
 
389 aa  106  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  27.01 
 
 
396 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  25.66 
 
 
426 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3470  major facilitator transporter  24.79 
 
 
421 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1723  putative MFS family transporter protein  29.02 
 
 
384 aa  102  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0101  major facilitator transporter  28.8 
 
 
426 aa  99.8  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  25.44 
 
 
427 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  25.14 
 
 
726 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0020  putative MFS family transporter protein  24.86 
 
 
384 aa  96.3  8e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>