More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0766 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0766  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
147 aa  286  8e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1335  50S ribosomal protein L9  99.32 
 
 
147 aa  284  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.779246  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0691  50S ribosomal protein L9  97.28 
 
 
147 aa  281  3.0000000000000004e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.965634  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0755  50S ribosomal protein L9  82.31 
 
 
147 aa  247  3e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1220  50S ribosomal protein L9  62.16 
 
 
148 aa  187  5e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.592412  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1975  50S ribosomal protein L9  62.42 
 
 
149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  60.54 
 
 
147 aa  178  2e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1000  50S ribosomal protein L9  59.86 
 
 
147 aa  174  3e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1029  ribosomal protein L9  62.84 
 
 
148 aa  169  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0075177  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1375  50S ribosomal protein L9  55.41 
 
 
148 aa  159  9e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0636184  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  41.22 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  43.92 
 
 
148 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 
148 aa  104  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 
149 aa  103  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 
148 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
148 aa  98.6  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0740  ribosomal protein L9  40.69 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  37.16 
 
 
159 aa  98.2  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 
151 aa  98.2  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 
148 aa  97.8  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  38.89 
 
 
147 aa  97.1  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  36 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 
150 aa  97.1  8e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
151 aa  95.9  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
151 aa  94  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 
149 aa  93.6  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  37.24 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
171 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 
151 aa  90.1  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5339  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
148 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000103383  hitchhiker  0.00000000147927 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  34.93 
 
 
148 aa  89.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  33.78 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1976  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 
151 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0014  50S ribosomal protein L9P  37.41 
 
 
151 aa  89  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  39.74 
 
 
149 aa  89  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5596  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
148 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  34.48 
 
 
152 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1355  ribosomal protein L9  36.05 
 
 
152 aa  87.8  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0012  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
154 aa  87.8  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181348  hitchhiker  0.0000209307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  33.79 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 
148 aa  87  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 
148 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 
148 aa  86.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000483517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 
148 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5718  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 
148 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000626689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5579  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 
148 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17506e-22 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  30.14 
 
 
149 aa  86.7  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4009  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015297  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2002  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148705  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  32.19 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  33.11 
 
 
148 aa  84.7  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  29.93 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  34.25 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  33.78 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  33.11 
 
 
149 aa  84  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  33.11 
 
 
168 aa  84  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 
148 aa  84.3  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 
148 aa  84  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  33.78 
 
 
167 aa  84  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  32.88 
 
 
148 aa  83.6  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3244  50S ribosomal protein L9  32.41 
 
 
152 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1966  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
150 aa  83.6  9e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  31.58 
 
 
165 aa  83.6  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  34.72 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  34.72 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2007  ribosomal protein L9  33.33 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2852  50S ribosomal protein L9  32.41 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  33.79 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  36 
 
 
151 aa  82  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2538  50S ribosomal protein L9  36.81 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  36.42 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  35.81 
 
 
151 aa  82  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  35.06 
 
 
149 aa  82  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2897  50S ribosomal protein L9  34.01 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000174347  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  30.41 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  29.66 
 
 
148 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl083  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000770286  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  31.29 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  30.14 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_482  ribosomal protein L9  35.33 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0894  50S ribosomal protein L9  36.71 
 
 
149 aa  80.1  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000571684  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  34.84 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6995  ribosomal protein L9  33.55 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  36.09 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  34.84 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0789  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  34.84 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1765  50S ribosomal protein L9  32.89 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  32.65 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>