More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0541 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1443  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0541  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0512  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.083045  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0452  30S ribosomal protein S7  98.72 
 
 		 156 aa  315  2e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0187  30S ribosomal protein S7  91.03 
 
 		 156 aa  296  5e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00102254  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0180  30S ribosomal protein S7  89.74 
 
 		 156 aa  295  2e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0647203  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1312  30S ribosomal protein S7  89.1 
 
 		 156 aa  294  3e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342852  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1659  30S ribosomal protein S7  89.74 
 
 		 156 aa  293  9e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.13751  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0356  ribosomal protein S7  80.77 
 
 		 156 aa  272  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000114638  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0356  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 		 155 aa  243  4.9999999999999997e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1949  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 158 aa  214  5e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2963  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 158 aa  209  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.255564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  62.58 
 
 		 156 aa  208  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  61.29 
 
 		 156 aa  206  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  206  9e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  59.35 
 
 		 156 aa  205  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2328  30S ribosomal protein S7  61.29 
 
 		 155 aa  206  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000186286  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  61.29 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2778  ribosomal protein S7  61.29 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  59.35 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  63.51 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  58.06 
 
 		 157 aa  204  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  61.29 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  59.35 
 
 		 156 aa  203  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  203  6e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 155 aa  203  9e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  203  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 156 aa  203  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1222  30S ribosomal protein S7  63.51 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000188964  hitchhiker  0.00370144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  58.06 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  59.35 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  59.35 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  59.35 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  56.77 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  59.35 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2173  ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 155 aa  200  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147945  normal  0.690329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 156 aa  200  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  60.81 
 
 		 156 aa  199  8e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3999  ribosomal protein S7  63.95 
 
 		 156 aa  199  9e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000436964  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2732  30S ribosomal protein S7  59.35 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0236  30S ribosomal protein S7  60.14 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000112284  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2822  30S ribosomal protein S7  60.96 
 
 		 156 aa  198  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0935176 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 156 aa  198  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  197  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0705  30S ribosomal protein S7  61.29 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  58.06 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  59.35 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0754  30S ribosomal protein S7  59.35 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.259118 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  60.14 
 
 		 156 aa  197  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  56.13 
 
 		 156 aa  197  6e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  59.35 
 
 		 156 aa  197  6e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  56.13 
 
 		 156 aa  197  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  56.13 
 
 		 156 aa  197  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3439  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 156 aa  197  6e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000192356  decreased coverage  0.0000249886 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf313  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 156 aa  196  7.999999999999999e-50  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0990117  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  58.06 
 
 		 156 aa  196  9e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  58.06 
 
 		 156 aa  196  9e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0076  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  58.06 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1709  30S ribosomal protein S7  58.06 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0343  30S ribosomal protein S7  58.06 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  58.06 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0357  30S ribosomal protein S7  58.06 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000656375  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2538  30S ribosomal protein S7  58.06 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.655975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0319  ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000298761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  58.06 
 
 		 156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  58.06 
 
 		 156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>