210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0355 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0355  SMR family multidrug efflux pump  100 
 
 
112 aa  214  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0332  SMR family multidrug efflux pump  99.11 
 
 
112 aa  212  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.887885  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1655  SMR family multidrug efflux pump  97.32 
 
 
112 aa  187  5e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0677066  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1392  putative multidrug resistance protein, SMR family  80.73 
 
 
115 aa  154  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.464032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2904  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 
111 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4115  sugE protein  43.69 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3956  small multidrug resistance protein  43.69 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.193441  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4435  sugE protein  43.69 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.944937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4232  sugE protein  43.69 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4288  sugE protein  42.72 
 
 
110 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.948578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4343  sugE protein  42.72 
 
 
110 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3967  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 
110 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0909  sugE protein  42.72 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000446848  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4324  sugE protein  42.72 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80388  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4068  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4914  SugE protein  40.2 
 
 
231 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0324  SugE protein  39.22 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1886  sugE protein  38.78 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1073  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.15784e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0792  sugE protein  37.37 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000018109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0741  quaternary ammonium compound-resistance protein  37.37 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00140212  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0728  quaternary ammonium compound-resistance protein  37.37 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00042757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0832  sugE protein  37.37 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381598  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0927  putative sugE protein  37.37 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3479e-48 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0996  putative sugE protein  37.37 
 
 
114 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000683055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0744  small multidrug resistance protein  36.36 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0925  sugE protein, putative  36.36 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0705375  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0887  putative sugE protein  37.37 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.373229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4447  putative sugE protein  36.36 
 
 
114 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00163881  normal  0.507706 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  38 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  38 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  38 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  30.19 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1183  chaperonin  33.33 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  31.43 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  33.66 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  29.91 
 
 
111 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2408  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272126  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1336  chaperonin  32.35 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.660374  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  34.95 
 
 
105 aa  61.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2191  small multidrug resistance protein  32.65 
 
 
103 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  30.19 
 
 
106 aa  60.5  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0613  hypothetical protein  30.77 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0595  hypothetical protein  30.77 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  26.36 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  31.43 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1533  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.447662  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  30.19 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2843  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1608  small multidrug resistance protein  32.95 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2825  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  30.19 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1683  small multidrug resistance protein  32.95 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.656055  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2970  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.546887 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  26.47 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  28.71 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1722  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  29.25 
 
 
106 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1901  sugE protein  32.18 
 
 
104 aa  57  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  30.48 
 
 
105 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  29.25 
 
 
106 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0272  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  26.73 
 
 
106 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  26.73 
 
 
106 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  29.7 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1338  membrane transporter  28.3 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.265274  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  27.72 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1676  small multidrug resistance protein  32.18 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  26.73 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3312  small multidrug resistance protein  28.28 
 
 
106 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  26.73 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  26.73 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  26.73 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  26.73 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  26.73 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  31.13 
 
 
106 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  26.73 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  26.73 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1005  sugE protein  33.66 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  32.69 
 
 
104 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0600  small multidrug resistance protein  34.18 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1502  small multidrug resistance protein  28.3 
 
 
109 aa  55.5  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  27.72 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  26.17 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  26.73 
 
 
104 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  27.62 
 
 
105 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  28.85 
 
 
104 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  25.23 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  26.73 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  25.74 
 
 
104 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  26.73 
 
 
105 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0283  SugE protein  32.67 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  27.45 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  27.45 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  27.36 
 
 
153 aa  53.5  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  27.36 
 
 
106 aa  53.9  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  26.73 
 
 
105 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.218727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>