199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0311 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  486  1e-136  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  80.17 
 
 
239 aa  387  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  75.95 
 
 
239 aa  371  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  74.15 
 
 
232 aa  337  7e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  39.58 
 
 
240 aa  192  4e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  40.25 
 
 
241 aa  186  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0514  methyltransferase domain-containing protein  38.59 
 
 
242 aa  158  7e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  25 
 
 
255 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  32.26 
 
 
261 aa  94.4  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  28.85 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  23.93 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  24.6 
 
 
299 aa  68.6  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  26.49 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  29.48 
 
 
294 aa  65.1  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  31.29 
 
 
275 aa  65.1  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  25.9 
 
 
323 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  28.78 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  25.17 
 
 
288 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  30.3 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  27.75 
 
 
268 aa  59.3  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  29.69 
 
 
279 aa  59.3  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  22.76 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  32.09 
 
 
286 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  33.09 
 
 
286 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  32.99 
 
 
218 aa  55.8  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  24.68 
 
 
270 aa  55.5  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 
218 aa  55.5  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  31.86 
 
 
203 aa  55.1  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  25.69 
 
 
284 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  23.76 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3359  hypothetical protein  29.63 
 
 
239 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  29.06 
 
 
274 aa  52.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0855  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
240 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.5 
 
 
232 aa  52.8  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  31.52 
 
 
221 aa  52.8  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8959  hypothetical protein  29.37 
 
 
261 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  23.61 
 
 
284 aa  52.8  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  25.38 
 
 
265 aa  52  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  28.41 
 
 
204 aa  52  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
258 aa  52  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  22.97 
 
 
280 aa  52  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  27.41 
 
 
279 aa  52  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  25.41 
 
 
278 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  29.03 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0403  putative methyltransferase  36.25 
 
 
210 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00297063  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  24.26 
 
 
229 aa  50.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2314  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.25 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0251558  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  22.32 
 
 
302 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  23.02 
 
 
289 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
279 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1076  Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II-like protein  30.69 
 
 
176 aa  49.7  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  27.78 
 
 
279 aa  49.7  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
257 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.36 
 
 
232 aa  48.9  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  24.47 
 
 
270 aa  48.9  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  26.61 
 
 
283 aa  48.9  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  34.18 
 
 
241 aa  48.5  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  32.53 
 
 
226 aa  48.5  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.72 
 
 
291 aa  48.5  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2351  methyltransferase type 11  32.22 
 
 
263 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0117235  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  23.62 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  28.09 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2236  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.71 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0596269  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  26.25 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3939  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.11 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  30.88 
 
 
279 aa  47.4  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2692  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
190 aa  46.6  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.05 
 
 
254 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  29.03 
 
 
218 aa  47  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
293 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  28.47 
 
 
271 aa  46.6  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.17 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  29.73 
 
 
254 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
254 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  28.99 
 
 
216 aa  46.2  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.94 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.94 
 
 
207 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  28.05 
 
 
254 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2634  hypothetical protein  25.16 
 
 
268 aa  46.2  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.167376  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.77 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.77 
 
 
232 aa  45.8  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  26.09 
 
 
250 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  23.71 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.85 
 
 
256 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  23.71 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  31.11 
 
 
194 aa  45.8  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  23.71 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  30.14 
 
 
256 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  24.19 
 
 
302 aa  45.4  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.04 
 
 
259 aa  45.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.57 
 
 
255 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 
259 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  33.71 
 
 
219 aa  45.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  28 
 
 
248 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 
259 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  28.81 
 
 
259 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  27.34 
 
 
274 aa  45.4  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  23.91 
 
 
280 aa  45.1  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>