27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0272 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0272  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 210 aa  418  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.635671  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0023  anthranilate synthase component II  50 
 
 		 71 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000850682  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  32.14 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4920  putative phage repressor  25 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  27.65 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13403  hypothetical protein  24.19 
 
 		 255 aa  53.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  23.68 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  30.82 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  29.66 
 
 		 229 aa  51.6  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  25.51 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  33.86 
 
 		 214 aa  48.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  27.89 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  29.1 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  26.29 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  32.28 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  25.35 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  22.34 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  31.58 
 
 		 292 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  31.54 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  30 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  28.57 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  30.15 
 
 		 225 aa  45.1  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  30.97 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  25.14 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2421  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 150 aa  42.4  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  20.67 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0021  XRE family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 161 aa  41.6  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>