25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0250 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0250  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  910  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1284  protein of unknown function DUF935  22.25 
 
 
524 aa  97.1  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02991e-32 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3783  hypothetical protein  27.94 
 
 
537 aa  94.4  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2932  hypothetical protein  24.03 
 
 
496 aa  86.3  1e-15  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163033  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3373  hypothetical protein  23.75 
 
 
523 aa  83.6  7e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0433  protein of unknown function DUF935  22.26 
 
 
510 aa  67.8  4e-10  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0671  protein of unknown function DUF935  21.92 
 
 
530 aa  62.8  1e-08  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1877  hypothetical protein  25.94 
 
 
582 aa  57  6e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1002  Mu-like prophage protein  23.84 
 
 
505 aa  56.2  1e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2680  hypothetical protein  30.28 
 
 
521 aa  56.6  1e-06  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0674  hypothetical protein  28.87 
 
 
519 aa  54.7  3e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0763  hypothetical protein  28.87 
 
 
519 aa  54.7  3e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4502  hypothetical protein  22.64 
 
 
544 aa  55.1  3e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2101  hypothetical protein  21.83 
 
 
543 aa  54.3  4e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0242078  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1299  hypothetical protein  21.83 
 
 
543 aa  54.3  4e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0265  hypothetical protein  22.22 
 
 
429 aa  52.8  1e-05  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3393  protein of unknown function DUF935  20.68 
 
 
543 aa  52.4  2e-05  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219922  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3047  hypothetical protein  22.42 
 
 
517 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88762  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3006  hypothetical protein  22.5 
 
 
517 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3417  Mu-like protein prophage protein gp29-like protein  26.71 
 
 
545 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.610061  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1641  hypothetical protein  21.66 
 
 
523 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2089  hypothetical protein  25.5 
 
 
528 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00551419  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1912  protein of unknown function DUF935  28.87 
 
 
511 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2136  hypothetical protein  24.83 
 
 
538 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1968  hypothetical protein  23.15 
 
 
523 aa  43.5  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.418273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>