More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0200 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0200  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
172 aa  348  2e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0239  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
172 aa  348  2e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0217  translation initiation factor IF-3  99.42 
 
 
172 aa  347  5e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0029  translation initiation factor IF-3  90.06 
 
 
173 aa  286  1e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0082  translation initiation factor IF-3  73.68 
 
 
171 aa  267  4e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0329  translation initiation factor IF-3  80.23 
 
 
172 aa  263  5.999999999999999e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000359846  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1818  translation initiation factor IF-3  83.03 
 
 
165 aa  261  4.999999999999999e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.228131  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1701  translation initiation factor IF-3  79.07 
 
 
172 aa  258  2e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00889873  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0067  translation initiation factor IF-3  65.12 
 
 
172 aa  227  5e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101132  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0612  translation initiation factor IF-3  71.51 
 
 
173 aa  221  4e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  46.06 
 
 
207 aa  157  7e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  46.99 
 
 
190 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  46.95 
 
 
164 aa  154  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  42.94 
 
 
195 aa  153  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  42.94 
 
 
195 aa  153  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  42.94 
 
 
195 aa  153  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  42.94 
 
 
195 aa  153  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  45.78 
 
 
202 aa  153  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  42.94 
 
 
186 aa  153  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  44.17 
 
 
166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  44.17 
 
 
166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  44.17 
 
 
166 aa  151  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  44.17 
 
 
166 aa  151  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  42.94 
 
 
195 aa  151  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  44.17 
 
 
166 aa  150  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  42.94 
 
 
171 aa  150  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 
198 aa  149  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  43.9 
 
 
357 aa  147  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  44.91 
 
 
198 aa  147  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  46.95 
 
 
173 aa  147  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  44.17 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  41.83 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  44.85 
 
 
197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  39.63 
 
 
219 aa  143  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  41.98 
 
 
179 aa  143  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  43.27 
 
 
173 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  41.52 
 
 
187 aa  142  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  44.91 
 
 
190 aa  142  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  44.72 
 
 
192 aa  141  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  42.68 
 
 
194 aa  140  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  42.07 
 
 
194 aa  140  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  42.07 
 
 
194 aa  140  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  42.11 
 
 
173 aa  140  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  42.94 
 
 
177 aa  140  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  43.21 
 
 
172 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  42.07 
 
 
164 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  37.28 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  40.49 
 
 
238 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  40.49 
 
 
225 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  41.36 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  43.83 
 
 
175 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  40.85 
 
 
178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  44.94 
 
 
194 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  44.1 
 
 
173 aa  138  4.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  40.83 
 
 
176 aa  137  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  41.98 
 
 
174 aa  137  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  43.56 
 
 
183 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  43.56 
 
 
183 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  43.56 
 
 
183 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  40.99 
 
 
186 aa  136  1e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  43.56 
 
 
177 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  41.61 
 
 
202 aa  137  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  45.06 
 
 
176 aa  136  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000720798  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  41.72 
 
 
177 aa  137  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  45 
 
 
169 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  39.52 
 
 
205 aa  136  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  42.38 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  40.46 
 
 
175 aa  135  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  41.04 
 
 
196 aa  135  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  39.26 
 
 
164 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  40.99 
 
 
252 aa  134  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  40.36 
 
 
243 aa  134  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  41.36 
 
 
173 aa  134  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  45 
 
 
176 aa  134  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  39.88 
 
 
170 aa  133  9e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  40.94 
 
 
178 aa  134  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  44.31 
 
 
171 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  40.99 
 
 
171 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  40.74 
 
 
180 aa  133  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  40.24 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  42.07 
 
 
178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  42.07 
 
 
178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  40.99 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  42.07 
 
 
193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  38.18 
 
 
174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  41.89 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  40.94 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  39.76 
 
 
227 aa  132  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  40.37 
 
 
178 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  38.89 
 
 
176 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  40.12 
 
 
173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  40.99 
 
 
204 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  40.49 
 
 
179 aa  131  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  39.16 
 
 
249 aa  131  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  42 
 
 
154 aa  131  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  39.88 
 
 
243 aa  131  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  39.31 
 
 
238 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  39.88 
 
 
176 aa  131  6e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  39.31 
 
 
238 aa  131  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  39.31 
 
 
238 aa  131  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.335133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>