More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0199 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  53.32 
 
 		 646 aa  639    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 636 aa  641    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 		 645 aa  650    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0199  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 602 aa  1232    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0028  threonyl-tRNA synthetase  87.4 
 
 		 603 aa  1095    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 645 aa  643    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0066  threonyl-tRNA synthetase  66.33 
 
 		 602 aa  858    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000216362  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0611  threonyl-tRNA synthetase  76.94 
 
 		 609 aa  984    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.260291  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0238  threonyl-tRNA synthetase  98.84 
 
 		 602 aa  1221    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0330  threonyl-tRNA synthetase  75.83 
 
 		 606 aa  960    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000295964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  54.28 
 
 		 636 aa  652    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 636 aa  654    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1819  threonyl-tRNA synthetase  76.32 
 
 		 606 aa  969    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.196151  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0081  threonyl-tRNA synthetase  73.55 
 
 		 605 aa  936    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000716431  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0216  threonyl-tRNA synthetase  98.5 
 
 		 602 aa  1213    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1702  threonyl-tRNA synthetase  75.91 
 
 		 617 aa  973    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000310236  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 		 636 aa  647    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 644 aa  631  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 649 aa  624  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 644 aa  618  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 644 aa  616  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 644 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 		 638 aa  610  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 644 aa  601  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 647 aa  596  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 635 aa  591  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 637 aa  587  1e-166  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 643 aa  579  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 		 643 aa  580  1e-164  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 635 aa  580  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 638 aa  578  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 643 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 		 644 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 637 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 640 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 639 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 640 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 639 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 		 633 aa  573  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 639 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 640 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 640 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 637 aa  571  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 639 aa  571  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 639 aa  571  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 639 aa  571  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 633 aa  571  1e-161  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 634 aa  570  1e-161  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 640 aa  567  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 639 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 635 aa  566  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 639 aa  566  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 635 aa  565  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 634 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0627  threonyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 588 aa  560  1e-158  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 636 aa  558  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 644 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 644 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 640 aa  557  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 635 aa  554  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 634 aa  550  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 640 aa  551  1e-155  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 640 aa  549  1e-155  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 638 aa  546  1e-154  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 636 aa  545  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 638 aa  547  1e-154  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 646 aa  542  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 637 aa  541  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 637 aa  541  1e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16370  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  48.43 
 
 		 586 aa  543  1e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.12349 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 637 aa  545  1e-153  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  49.82 
 
 		 582 aa  540  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 631 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 669 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 648 aa  540  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04450  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  46.94 
 
 		 586 aa  538  1e-151  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0386598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4616  threonyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 643 aa  532  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 640 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 642 aa  535  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 640 aa  533  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 582 aa  533  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000323411  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 645 aa  533  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 582 aa  529  1e-149  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 638 aa  529  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3623  threonyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 643 aa  531  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 640 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 638 aa  528  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 		 635 aa  531  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 640 aa  530  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1870  threonyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 635 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47552  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 635 aa  531  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 640 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 640 aa  528  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3225  threonyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 640 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 640 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0935  threonyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 611 aa  525  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0867221  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1967  threonyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 640 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134711  normal  0.0132251 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 640 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3481  threonyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 640 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800828  normal  0.0249513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1745  threonyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 637 aa  523  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>