More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0191 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0208  recombination factor protein RarA  98.98 
 
 		 393 aa  788    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0229  recombination factor protein RarA  99.24 
 
 		 393 aa  790    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0191  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 393 aa  794    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1569  recombination factor protein RarA  71.5 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1825  recombination factor protein RarA  65.98 
 
 		 394 aa  521  1e-147  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0824  recombination factor protein RarA  61.73 
 
 		 392 aa  495  1e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00630594  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1776  recombination factor protein RarA  60.36 
 
 		 397 aa  482  1e-135  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0066  AAA ATPase central domain protein  59.08 
 
 		 396 aa  458  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0211  recombination factor protein RarA  53.35 
 
 		 393 aa  393  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  39.76 
 
 		 428 aa  276  5e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  39.31 
 
 		 435 aa  270  4e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0815  AAA ATPase central domain protein  39.44 
 
 		 395 aa  268  1e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  39.86 
 
 		 435 aa  265  7e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  36.71 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  39.34 
 
 		 457 aa  263  3e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  37.2 
 
 		 446 aa  263  4e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  38.97 
 
 		 432 aa  263  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  38.76 
 
 		 446 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  38.46 
 
 		 453 aa  262  8e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  38.48 
 
 		 447 aa  260  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1853  recombination factor protein RarA  38.37 
 
 		 430 aa  259  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  37.23 
 
 		 443 aa  258  1e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  39.53 
 
 		 420 aa  258  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  37.1 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  38.55 
 
 		 441 aa  257  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  39.9 
 
 		 439 aa  257  3e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  36.45 
 
 		 447 aa  257  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  41.01 
 
 		 429 aa  256  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  40.14 
 
 		 419 aa  255  9e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  39.9 
 
 		 445 aa  255  9e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  39.95 
 
 		 426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  37.65 
 
 		 446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1564  recombination factor protein RarA  38.58 
 
 		 404 aa  254  3e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.228018 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  35.63 
 
 		 461 aa  252  7e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1125  AAA ATPase central domain protein  36.94 
 
 		 408 aa  252  8.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180693  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  38.94 
 
 		 425 aa  251  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  40.51 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  36.96 
 
 		 423 aa  250  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0339  recombination factor protein RarA  36.34 
 
 		 408 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  37.29 
 
 		 426 aa  247  2e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  37.29 
 
 		 441 aa  246  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  36.99 
 
 		 434 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2010  AAA ATPase central domain protein  35.76 
 
 		 484 aa  245  8e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1168  recombination factor protein RarA  37.34 
 
 		 407 aa  245  8e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  36.61 
 
 		 435 aa  245  9e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  36.75 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  39.14 
 
 		 425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  37.77 
 
 		 454 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1323  recombination factor protein RarA  38.06 
 
 		 411 aa  243  3.9999999999999997e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0587994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  34.06 
 
 		 437 aa  243  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  35.77 
 
 		 435 aa  242  7e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  35.93 
 
 		 450 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  36.6 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  37.04 
 
 		 456 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1401  recombination factor protein RarA  35.84 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  37.5 
 
 		 441 aa  239  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  36.63 
 
 		 449 aa  239  4e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  37.91 
 
 		 429 aa  239  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  34.76 
 
 		 456 aa  239  6.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  35.71 
 
 		 447 aa  238  9e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  35.44 
 
 		 455 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  35.65 
 
 		 440 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  33.88 
 
 		 446 aa  237  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  37.17 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  37.05 
 
 		 441 aa  237  3e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0414  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  35.16 
 
 		 599 aa  236  4e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174137  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1998  recombination factor protein RarA  38.12 
 
 		 375 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.805499  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  37.31 
 
 		 447 aa  235  8e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  35.92 
 
 		 500 aa  235  8e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  36.74 
 
 		 739 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  34.66 
 
 		 599 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  35.93 
 
 		 444 aa  233  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  37.98 
 
 		 423 aa  234  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  34.29 
 
 		 445 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  34.29 
 
 		 445 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  34.29 
 
 		 445 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  35.07 
 
 		 731 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  35.02 
 
 		 429 aa  233  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0515  recombination factor protein RarA  36.65 
 
 		 412 aa  231  1e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  35.95 
 
 		 435 aa  230  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  36.19 
 
 		 448 aa  229  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0144  recombination factor protein RarA  37.23 
 
 		 378 aa  229  9e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  36.64 
 
 		 431 aa  228  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0082  recombination factor protein RarA  36.76 
 
 		 419 aa  228  1e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0826  recombination factor protein RarA  35.4 
 
 		 462 aa  228  2e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1846  recombination factor protein RarA  34.05 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  35.51 
 
 		 440 aa  226  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  37.31 
 
 		 734 aa  226  6e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  34.75 
 
 		 432 aa  226  7e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1685  recombination factor protein RarA  34.38 
 
 		 424 aa  226  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000466548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  35.68 
 
 		 428 aa  226  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1718  recombination factor protein RarA  34.38 
 
 		 424 aa  226  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000735591  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  37.31 
 
 		 734 aa  225  9e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  34.48 
 
 		 494 aa  225  9e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05617  DNA replication ATPase (Eurofung)  38.42 
 
 		 528 aa  225  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00143305  normal  0.0551147 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  36.12 
 
 		 441 aa  225  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  32.51 
 
 		 519 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  34.06 
 
 		 452 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  36.55 
 
 		 465 aa  224  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1978  recombination factor protein RarA  36.04 
 
 		 422 aa  223  3e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>