More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0172 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  100 
 
 
253 aa  507  1e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1050  biopolymer transport ExbB protein  54.72 
 
 
251 aa  215  4e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3185  biopolymer transport protein ExbB  46.76 
 
 
244 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02880  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  46.3 
 
 
244 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0692  tonB-system energizer ExbB  46.3 
 
 
244 aa  168  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4317  biopolymer transport protein ExbB  46.3 
 
 
244 aa  168  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3291  biopolymer transport protein ExbB  46.3 
 
 
244 aa  168  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0689  biopolymer transport protein ExbB  46.3 
 
 
244 aa  168  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02830  hypothetical protein  46.3 
 
 
244 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3475  biopolymer transport protein ExbB  46.3 
 
 
244 aa  168  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3434  biopolymer transport protein ExbB  46.3 
 
 
244 aa  168  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.45 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0388  tonB-system energizer ExbB  43.06 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3413  biopolymer transport protein ExbB  43.84 
 
 
244 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3508  biopolymer transport protein ExbB  43.84 
 
 
244 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3407  biopolymer transport protein ExbB  43.84 
 
 
244 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.512684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3342  biopolymer transport protein ExbB  43.84 
 
 
244 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3333  biopolymer transport protein ExbB  43.84 
 
 
244 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0345  tonB-system energizer ExbB  43.06 
 
 
336 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10630  tonB-system proton channel, ExbB  40.18 
 
 
359 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0184871  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3417  biopolymer transport protein ExbB  43.52 
 
 
238 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0069  TonB system transport protein ExbB  42.45 
 
 
318 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5555  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.51 
 
 
317 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0167  tonB-system energizer ExbB  40.57 
 
 
323 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.115924 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5306  ferric siderophore transport system protein ExbB  40.57 
 
 
320 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5215  TonB-system energizer ExbB type-1  40.57 
 
 
324 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3639  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.97 
 
 
366 aa  156  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5354  tonB-system energizer ExbB  40.57 
 
 
326 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325713  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4211  TonB-system energizer ExbB type-1  45.5 
 
 
323 aa  156  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3598  tonB-system energizer ExbB  41.1 
 
 
304 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3761  tonB-system energizer ExbB  42.52 
 
 
296 aa  153  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0672  tonB-system energizer ExbB  42.13 
 
 
345 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0268  tonB-system energizer ExbB  41.67 
 
 
330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.522492  normal  0.43145 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0591  tonB-system energizer ExbB  44.33 
 
 
237 aa  151  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3333  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.17 
 
 
294 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  0.666344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1309  putative biopolymer transport protein  38.18 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1146  TonB-system energizer ExbB type-1  42.35 
 
 
325 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200277  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.82 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2357  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.64 
 
 
265 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.243878  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1980  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.27 
 
 
288 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3543  biopolymer transport protein ExbB  41.58 
 
 
313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0936  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.1 
 
 
283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3967  tonB-system energizer ExbB  42.41 
 
 
303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4004  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.2 
 
 
267 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.894756  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1241  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.28 
 
 
266 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175098  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.3 
 
 
286 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1432  tonB-system energizer ExbB  40.19 
 
 
257 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1131  tonB-system energizer ExbB  36.87 
 
 
348 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4540  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.19 
 
 
301 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0703  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.15 
 
 
400 aa  142  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3137  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.01 
 
 
247 aa  142  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2419  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.65 
 
 
222 aa  141  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2418  tonB-system energizer ExbB  43.01 
 
 
265 aa  141  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5985  tonB-system energizer ExbB  38.99 
 
 
341 aa  141  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.70641  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2040  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.62 
 
 
421 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.853694  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4649  tonB-system energizer ExbB  40 
 
 
335 aa  139  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0826  tonB-system energizer ExbB  38.54 
 
 
348 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038397 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3310  tonB-system energizer ExbB  40.18 
 
 
242 aa  139  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885209  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4273  TonB-system energizer ExbB type-1  37.17 
 
 
327 aa  138  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.69 
 
 
229 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1254  TonB-system energizer ExbB type-1  40.41 
 
 
338 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.53 
 
 
337 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608707  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2228  biopolymer transport  41.05 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0375  TonB-system energizer ExbB type-1  42.13 
 
 
309 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.14 
 
 
355 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501984  normal  0.346367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.09 
 
 
246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  38.65 
 
 
237 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_004310  BR1666  biopolymer transport protein ExbB  39.38 
 
 
292 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  40.28 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1267  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.61 
 
 
318 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137669  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  39.35 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0747  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.06 
 
 
337 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3697  tonB-system energizer ExbB  40.41 
 
 
316 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2305  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.05 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.605743  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  38.86 
 
 
274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  40.95 
 
 
238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1612  ExbB  38.86 
 
 
310 aa  133  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.9 
 
 
224 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  39.34 
 
 
239 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0235  tonB-system energizer ExbB  39.38 
 
 
355 aa  133  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.700066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  39.34 
 
 
239 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  36.79 
 
 
241 aa  132  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  39.73 
 
 
241 aa  132  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  40.76 
 
 
238 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  40.76 
 
 
238 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.62 
 
 
227 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2155  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.41 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.62 
 
 
237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  40.76 
 
 
238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  40 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.7 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.12 
 
 
243 aa  129  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.17 
 
 
229 aa  129  7.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.68 
 
 
237 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.68 
 
 
237 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.2 
 
 
237 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2579  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.66 
 
 
363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  37.73 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0920  biopolymer transport protein, ExbB  38.66 
 
 
349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0727  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.24 
 
 
431 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242585  normal  0.505103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>