47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0135 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0135  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  888    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0584774  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0154  hypothetical protein  97.51 
 
 		 445 aa  865    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0176  hypothetical protein  98.61 
 
 		 288 aa  578  1e-164  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0003  hypothetical protein  41.31 
 
 		 416 aa  257  4e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00559809  unclonable  0.0000000111615 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0175  hypothetical protein  94.74 
 
 		 159 aa  247  4e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2471  5-methylcytosine restriction system component- like protein  30.87 
 
 		 428 aa  202  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.248512 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2661  hypothetical protein  31.88 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3724  hypothetical protein  27.54 
 
 		 418 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1240  hypothetical protein  28.83 
 
 		 438 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0689849  hitchhiker  0.000177876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1654  hypothetical protein  28.02 
 
 		 424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3669  putative 5-methylcytosine restriction system component  25.65 
 
 		 436 aa  161  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7439  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  27.49 
 
 		 445 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3330  hypothetical protein  32.03 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2911  hypothetical protein  29.32 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1862  hypothetical protein  28.3 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4619  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  27.78 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000187053  hitchhiker  0.0000000628519 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1981  hypothetical protein  30.28 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51853  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4726  hypothetical protein  26.17 
 
 		 422 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3671  hypothetical protein  31.54 
 
 		 273 aa  119  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0993  hypothetical protein  27.82 
 
 		 437 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.235646  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1011  5-methylcytosine restriction system component-like protein  29.1 
 
 		 460 aa  117  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000144218  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1591  hypothetical protein  22.14 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1299  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  26.24 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000217939  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3309  IQ calmodulin-binding- domain protein  23.71 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3470  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  26.89 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00801853  normal  0.511219 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3270  hypothetical protein  25.71 
 
 		 453 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0179938  normal  0.335413 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4531  hypothetical protein  27.05 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.814257  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1386  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  24.64 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0863  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  22.3 
 
 		 418 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1703  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  26.52 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0225  conserved hypothetical protein, putative endonuclease  51.25 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.131581  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0976  hypothetical protein  23.24 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0362174 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0227  hypothetical protein  22.92 
 
 		 514 aa  68.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0395217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0350  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  30.08 
 
 		 687 aa  68.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05460  McrBC 5-methylcytosine restriction system component  23.46 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1561  5-methylcytosine restriction system component- like protein  25.28 
 
 		 451 aa  66.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0806  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  24.01 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0894928  hitchhiker  0.000053751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6960  hypothetical protein  25.19 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00920086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0253  hypothetical protein  21.54 
 
 		 498 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.13037  normal  0.68079 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0437  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  40.24 
 
 		 164 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  hitchhiker  0.00000000000258291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2402  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  22.44 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1283  5-methylcytosine restriction system component- like protein  28.06 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000503694  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3300  5-methylcytosine restriction system component- like protein  21.51 
 
 		 398 aa  53.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1213  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  22.41 
 
 		 351 aa  49.7  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.816052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3582  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  26.32 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3753  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  24.52 
 
 		 351 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.537146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0879  hypothetical protein  22.93 
 
 		 459 aa  46.6  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0515666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>