More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0102 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3894  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.96 
 
 
464 aa  635  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.43 
 
 
472 aa  648  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4507  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.76 
 
 
463 aa  650  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0605714 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.58 
 
 
474 aa  670  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4240  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.07 
 
 
458 aa  649  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.695259  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0008  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.13 
 
 
460 aa  654  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.366806  normal  0.022382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4486  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.85 
 
 
458 aa  648  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.21569e-05 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  91.81 
 
 
465 aa  879  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4247  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.91 
 
 
460 aa  657  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000144412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3948  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.35 
 
 
460 aa  658  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.440283  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0176  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.05 
 
 
483 aa  640  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2080  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.98 
 
 
478 aa  661  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.331414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.86 
 
 
478 aa  653  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58444  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  91.38 
 
 
465 aa  873  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.96 
 
 
464 aa  638  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2148  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.05 
 
 
461 aa  640  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4189  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.91 
 
 
460 aa  657  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.212641  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0218  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.77 
 
 
482 aa  664  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.933064  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6635  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.76 
 
 
484 aa  668  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0122  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.74 
 
 
464 aa  635  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4898  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.5 
 
 
458 aa  655  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.19623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.34 
 
 
484 aa  650  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106818  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5200  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.35 
 
 
458 aa  651  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.378441  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4100  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.91 
 
 
460 aa  657  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.740687  normal  0.359635 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4262  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.91 
 
 
460 aa  657  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.227124  normal  0.244926 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4226  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.13 
 
 
460 aa  656  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5431  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.91 
 
 
458 aa  644  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.17 
 
 
469 aa  637  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4202  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.13 
 
 
460 aa  656  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16362  normal  0.223697 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  90.3 
 
 
465 aa  862  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4176  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.13 
 
 
460 aa  656  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0938283  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4607  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.91 
 
 
458 aa  655  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.76 
 
 
463 aa  650  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4132  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.35 
 
 
460 aa  657  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.364679  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.79 
 
 
475 aa  667  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  69.3 
 
 
530 aa  657  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3845  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.2 
 
 
458 aa  647  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208529 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3015  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.96 
 
 
464 aa  634  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676639  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4042  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.96 
 
 
464 aa  634  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3968  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.96 
 
 
464 aa  634  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.76 
 
 
463 aa  650  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.36 
 
 
475 aa  664  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  68.55 
 
 
503 aa  636  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.53 
 
 
464 aa  635  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.22 
 
 
470 aa  681  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.86 
 
 
476 aa  643  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  98.92 
 
 
484 aa  937  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.3 
 
 
481 aa  647  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.1 
 
 
464 aa  636  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.92 
 
 
517 aa  658  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.76 
 
 
463 aa  650  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6356  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.35 
 
 
458 aa  655  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4462  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.48 
 
 
458 aa  652  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718336  hitchhiker  2.25829e-08 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.14 
 
 
509 aa  672  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0193  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.89 
 
 
475 aa  638  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.196024  normal  0.0120657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  68.22 
 
 
482 aa  659  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5295  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.91 
 
 
458 aa  644  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.122474 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1732  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.99 
 
 
521 aa  650  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.13 
 
 
480 aa  665  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1587  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.96 
 
 
459 aa  634  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.986893  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  67.39 
 
 
470 aa  639  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03560  hypothetical protein  69.91 
 
 
460 aa  657  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495097  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3993  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.26 
 
 
460 aa  652  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3941  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.94 
 
 
478 aa  651  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.67 
 
 
473 aa  641  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52160  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.26 
 
 
458 aa  640  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372288  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  95.26 
 
 
484 aa  900  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.89 
 
 
467 aa  662  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4106  ATP synthase F1, beta subunit  71.09 
 
 
485 aa  666  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3305  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.55 
 
 
459 aa  659  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384561  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  69.81 
 
 
487 aa  677  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7380  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.4 
 
 
484 aa  677  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230144  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.25 
 
 
473 aa  645  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.21 
 
 
465 aa  673  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4194  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.7 
 
 
460 aa  656  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.821346  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4257  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.13 
 
 
460 aa  657  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2587  ATP synthase F1, beta subunit  68.18 
 
 
458 aa  646  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282932  normal  0.0250722 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  68.47 
 
 
471 aa  652  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  68.1 
 
 
465 aa  647  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  67.67 
 
 
464 aa  639  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0515  ATP synthase F1, beta subunit  86.64 
 
 
465 aa  838  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6062  ATP synthase F1, beta subunit  67.38 
 
 
481 aa  639  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2325  ATP synthase F1, beta subunit  66.89 
 
 
462 aa  636  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0462267  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4547  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.56 
 
 
460 aa  660  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.31 
 
 
473 aa  642  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  67.75 
 
 
468 aa  639  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.6 
 
 
474 aa  641  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  69.48 
 
 
467 aa  656  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.65 
 
 
470 aa  685  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.7844e-05 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.6 
 
 
469 aa  640  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.32 
 
 
468 aa  639  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  6.21194e-13 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.43 
 
 
470 aa  683  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04083  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.7 
 
 
461 aa  653  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0301285  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4075  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.35 
 
 
460 aa  660  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.999659  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4196  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.35 
 
 
460 aa  660  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4146  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.35 
 
 
460 aa  660  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.11 
 
 
462 aa  663  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.55 
 
 
462 aa  658  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.4 
 
 
503 aa  640  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0171  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.79 
 
 
476 aa  669  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>