85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0099 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0139  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
173 aa  333  6e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0099  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
173 aa  333  6e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0111  F0F1 ATP synthase subunit delta  97.69 
 
 
173 aa  328  3e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.262179  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0192  F0F1 ATP synthase subunit delta  54.91 
 
 
173 aa  177  7e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.745397  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.77 
 
 
176 aa  123  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0914  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.34 
 
 
176 aa  119  1e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00240789  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0684  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.63 
 
 
176 aa  110  9e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0512  ATP synthase F1, delta subunit  36.36 
 
 
176 aa  110  9e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1528  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.07 
 
 
176 aa  109  2e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0797496  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1406  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.49 
 
 
177 aa  80.9  8e-15  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.233831  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0194  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.94 
 
 
177 aa  52  4e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4610  ATP synthase F1, delta subunit  31.11 
 
 
178 aa  49.7  2e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.994341  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  26.15 
 
 
178 aa  49.7  2e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4129  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.5 
 
 
177 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000754285  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  22.54 
 
 
178 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2747  ATP synthase F1, delta subunit  29.57 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00491756  normal  0.287613 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2328  ATP synthase F1, delta subunit  27.74 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000241371  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3897  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.62 
 
 
179 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6359  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.4 
 
 
178 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0252  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.89 
 
 
179 aa  45.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.4 
 
 
178 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2913  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.86 
 
 
180 aa  45.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0305  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.16 
 
 
180 aa  45.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790297 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0300  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.16 
 
 
180 aa  45.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3056  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.86 
 
 
180 aa  45.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0037  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.87 
 
 
179 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0129228  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  29.49 
 
 
178 aa  45.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  5.03063e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4243  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000376424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.03 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0369  F0F1 ATP synthase subunit delta  26 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  23.98 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0182  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.63 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.98764  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.98 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.85 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  4.02457e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4179  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.01182e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4205  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.1054e-05  normal  0.165641 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4223  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  4.62366e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3030  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.82 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0109  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.67 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00162422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  24.71 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06107  ATP synthase F1, delta subunit  24.31 
 
 
180 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.63 
 
 
179 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  0.702124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.83 
 
 
179 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.63 
 
 
179 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.14 
 
 
180 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.14 
 
 
180 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4254  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.87 
 
 
177 aa  42  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.177027  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4191  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.09 
 
 
177 aa  42  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000591932  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0094  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.63 
 
 
179 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3311  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.63 
 
 
179 aa  42.4  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0205663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1590  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.63 
 
 
179 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0134138  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2168  ATP synthase F1, delta subunit  32.39 
 
 
178 aa  42  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  4.94918e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3971  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.63 
 
 
179 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4045  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.63 
 
 
179 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3012  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.63 
 
 
179 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2954  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.63 
 
 
179 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0301983  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0417  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 
179 aa  42  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497202  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.14 
 
 
180 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5171  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 
177 aa  41.6  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00189703  decreased coverage  0.00512499 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.71 
 
 
180 aa  41.6  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4258  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.89 
 
 
177 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.510184  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4251  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 
177 aa  41.6  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.38372e-08  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03619  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 
177 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00523657  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3990  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.09 
 
 
177 aa  41.2  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934211  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03563  hypothetical protein  31.58 
 
 
177 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00259121  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4232  ATP synthase F1, delta subunit  31.58 
 
 
177 aa  41.6  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.245958  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4093  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.89 
 
 
177 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4078  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.89 
 
 
177 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.079303  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4199  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.89 
 
 
177 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  0.940305 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3951  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 
177 aa  41.6  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.56722e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.7 
 
 
178 aa  41.6  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4259  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 
177 aa  41.6  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000372939  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4103  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 
177 aa  41.6  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00374645  normal  0.126439 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.47 
 
 
180 aa  41.6  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4186  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 
177 aa  41.6  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.91061e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4149  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.89 
 
 
177 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0979605  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4489  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.78 
 
 
177 aa  41.2  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0316955  hitchhiker  5.55813e-06 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2872  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.24 
 
 
179 aa  41.2  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.63 
 
 
179 aa  40.8  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.63 
 
 
179 aa  40.8  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.63 
 
 
179 aa  40.8  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4873  ATP synthase F1, delta subunit  23.56 
 
 
176 aa  40.8  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.14 
 
 
180 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  1.10124e-15 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3969  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.48 
 
 
178 aa  40.8  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110961  normal  0.295514 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0324  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.43 
 
 
176 aa  40.8  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201646  normal  0.377172 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>