14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0098 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0098  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
170 aa  335  2e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0138  F0F1 ATP synthase subunit B  98.24 
 
 
170 aa  330  5e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.815294  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  96.47 
 
 
170 aa  289  1e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0191  F0F1 ATP synthase subunit B  56.47 
 
 
170 aa  197  6e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.658435  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1529  F0F1 ATP synthase subunit B  48.81 
 
 
172 aa  163  8e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.11288  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1734  F0F1 ATP synthase subunit B  45.73 
 
 
169 aa  150  7e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0913  F0F1 ATP synthase subunit B  46.43 
 
 
170 aa  149  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000548594  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0511  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.1 
 
 
171 aa  131  5e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0683  F0F1 ATP synthase subunit B  43.53 
 
 
171 aa  119  2e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.883671  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1407  F0F1 ATP synthase subunit B  31.76 
 
 
169 aa  105  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.969666  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.17 
 
 
193 aa  55.8  3e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  22.09 
 
 
192 aa  49.3  2e-05  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0334  F0F1 ATP synthase subunit B  31.65 
 
 
171 aa  40.4  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.603951  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  29.75 
 
 
264 aa  40.8  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>