30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0097 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0097  F0F1 ATP synthase subunit B'  100 
 
 
141 aa  279  9e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0109  F0F1 ATP synthase subunit B'  95.74 
 
 
141 aa  249  1e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0137  F0F1 ATP synthase subunit B'  96.45 
 
 
141 aa  249  1e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.725009  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0190  F0F1 ATP synthase subunit B'  54.61 
 
 
141 aa  130  6e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.453831  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1733  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.68 
 
 
140 aa  105  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1530  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.36 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.283854  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0912  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.43 
 
 
140 aa  90.9  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  3.95011e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0682  ATP synthase subunit B  39.72 
 
 
140 aa  88.2  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0510  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.06 
 
 
140 aa  87.8  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1408  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.61 
 
 
140 aa  79  2e-14  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  31.58 
 
 
168 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  29.85 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  30.7 
 
 
168 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  30.7 
 
 
168 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  30.7 
 
 
168 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  30.7 
 
 
168 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  30.7 
 
 
168 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  29.82 
 
 
168 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  29.82 
 
 
168 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  29.82 
 
 
168 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  30.39 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2622  F0F1 ATP synthase subunit B'  47.22 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2202  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.91 
 
 
161 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.024698  normal  0.231537 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  25.95 
 
 
175 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  30.17 
 
 
166 aa  40.8  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0803  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  20.93 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  23.31 
 
 
175 aa  40.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2614  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.11 
 
 
163 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434819  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2995  ATP synthase F0, B subunit  26.87 
 
 
259 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>