More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0093 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0093  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
305 aa  611  1e-174  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0105  methionyl-tRNA formyltransferase  99.02 
 
 
305 aa  608  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0133  methionyl-tRNA formyltransferase  98.69 
 
 
305 aa  606  1e-172  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  73.36 
 
 
303 aa  448  1e-125  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1729  methionyl-tRNA formyltransferase  56.76 
 
 
301 aa  347  1e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  50.66 
 
 
301 aa  313  2e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  1.90251e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0678  methionyl-tRNA formyltransferase  54.28 
 
 
302 aa  312  5e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0506  methionyl-tRNA formyltransferase  50.99 
 
 
319 aa  296  2e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1534  methionyl-tRNA formyltransferase  48.86 
 
 
304 aa  295  5e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1412  methionyl-tRNA formyltransferase  48.51 
 
 
302 aa  291  9e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  37.01 
 
 
312 aa  219  6e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  38.26 
 
 
312 aa  214  2e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  38.98 
 
 
309 aa  214  2e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 
313 aa  214  2e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  38.56 
 
 
318 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  39.02 
 
 
318 aa  206  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  39.6 
 
 
315 aa  205  7e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  37.42 
 
 
311 aa  205  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  37.29 
 
 
311 aa  202  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  39.29 
 
 
319 aa  202  5e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  37.29 
 
 
314 aa  202  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  37.66 
 
 
317 aa  200  2e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  38.16 
 
 
315 aa  199  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  38.16 
 
 
315 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  38.16 
 
 
315 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  36.48 
 
 
359 aa  199  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  35.92 
 
 
322 aa  197  1e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  38.49 
 
 
313 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  37.95 
 
 
316 aa  196  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  36.39 
 
 
315 aa  196  4e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  36.18 
 
 
315 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  37.25 
 
 
307 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 
315 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  37.17 
 
 
315 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  37.17 
 
 
315 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  37.17 
 
 
315 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  37.17 
 
 
315 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  37.17 
 
 
315 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  37.17 
 
 
315 aa  192  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  37.17 
 
 
315 aa  192  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 
310 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  37.17 
 
 
315 aa  192  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  37.17 
 
 
315 aa  192  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  37.95 
 
 
319 aa  192  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  37.17 
 
 
315 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  37.17 
 
 
315 aa  192  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  37.17 
 
 
315 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  37.17 
 
 
315 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  36.84 
 
 
307 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  37.38 
 
 
317 aa  191  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  36.84 
 
 
315 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  35.71 
 
 
312 aa  191  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  36.84 
 
 
315 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  37.95 
 
 
326 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  36.84 
 
 
307 aa  189  3e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  36.54 
 
 
301 aa  189  6e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  36.96 
 
 
320 aa  189  6e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  36.63 
 
 
318 aa  188  9e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  36.75 
 
 
318 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  33.66 
 
 
314 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  1.07655e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  36.75 
 
 
318 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.88499e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  36.75 
 
 
318 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  37.62 
 
 
318 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  36.75 
 
 
318 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  34.53 
 
 
314 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  37.42 
 
 
321 aa  186  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  36.72 
 
 
317 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 
320 aa  186  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  36.84 
 
 
307 aa  186  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  34.77 
 
 
313 aa  186  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  36.63 
 
 
314 aa  185  9e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  36.63 
 
 
314 aa  185  9e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  35.99 
 
 
310 aa  184  1e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  37.25 
 
 
314 aa  185  1e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  36.42 
 
 
318 aa  184  1e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  37.09 
 
 
318 aa  184  1e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.57015e-05 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  36.69 
 
 
310 aa  184  2e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  6.11556e-15 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0014  methionyl-tRNA formyltransferase  34.09 
 
 
329 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  36.09 
 
 
311 aa  183  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  34.1 
 
 
313 aa  183  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  36.22 
 
 
308 aa  183  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  34.2 
 
 
314 aa  183  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  34.29 
 
 
312 aa  183  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  37.95 
 
 
311 aa  183  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  36.75 
 
 
318 aa  182  4e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  34.2 
 
 
314 aa  183  4e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  33.88 
 
 
314 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  33.88 
 
 
314 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  4.92096e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  33.88 
 
 
314 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  33.88 
 
 
314 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  36.42 
 
 
318 aa  182  7e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  33.88 
 
 
314 aa  182  8e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  34.41 
 
 
332 aa  182  8e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  33.55 
 
 
314 aa  182  9e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  36.51 
 
 
314 aa  181  9e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  36.04 
 
 
310 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  35.05 
 
 
311 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  1.16959e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  36.04 
 
 
310 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  4.39837e-07 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  35.74 
 
 
315 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  35.2 
 
 
315 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>