More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0090 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  100 
 
 
84 aa  169  9e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  100 
 
 
84 aa  169  9e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  100 
 
 
84 aa  169  9e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  98.81 
 
 
84 aa  168  3e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  96.43 
 
 
85 aa  165  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  95.24 
 
 
85 aa  164  4e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  95.24 
 
 
85 aa  164  5e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  92.77 
 
 
85 aa  155  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0503  ribosomal protein L27  84.52 
 
 
85 aa  145  2e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  77.38 
 
 
85 aa  133  8e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 
84 aa  128  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.97888e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  75 
 
 
85 aa  127  5e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.90958e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  75 
 
 
85 aa  127  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 
85 aa  126  1e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.93871e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 
85 aa  125  1e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.40306e-15  unclonable  7.87501e-24 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 
85 aa  126  1e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
95 aa  125  2e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 
92 aa  124  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 
93 aa  123  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 
84 aa  122  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.53633e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
94 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
89 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
88 aa  118  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 
88 aa  117  4e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
84 aa  117  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.60272e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
87 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
87 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
98 aa  115  2e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.56783e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  64.29 
 
 
91 aa  114  4e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
95 aa  113  8e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.81623e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
90 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 
89 aa  111  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 
91 aa  110  8e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
92 aa  109  1e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
89 aa  110  1e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 
85 aa  108  2e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  70.73 
 
 
85 aa  108  2e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.26464e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 
97 aa  108  2e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  8.33239e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
89 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  62.65 
 
 
95 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  4.69897e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  65.06 
 
 
93 aa  108  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
87 aa  107  4e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
89 aa  107  4e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
90 aa  107  4e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
85 aa  107  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.91049e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 
88 aa  107  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  70.73 
 
 
85 aa  107  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0238  ribosomal protein L27  62.65 
 
 
87 aa  107  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4312  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
85 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4181  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
85 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186505  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4334  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
85 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
86 aa  107  8e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
89 aa  107  8e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
87 aa  106  8e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  1.09711e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
89 aa  107  8e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 
86 aa  106  9e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.34792e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 
90 aa  106  9e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 
95 aa  106  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2801  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
87 aa  105  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000884705  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
89 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
88 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 
85 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 
90 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
89 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0582  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
87 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00040366  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 
85 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0246  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 
85 aa  105  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  9.45082e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 
85 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  2.03934e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0485  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
87 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162621  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2821  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
86 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000571878  normal  0.308516 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
89 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 
85 aa  105  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3737  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 
85 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000346028  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0552  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
87 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  3.67957e-07  normal  0.045539 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0100  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
87 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00352754  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0510  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
87 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0309377  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
91 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3667  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
87 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  3.45306e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
89 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 
84 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  5.45576e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
88 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  61.45 
 
 
86 aa  104  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
85 aa  105  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
88 aa  104  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3066  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
86 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2957  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
86 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3892  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 
89 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624543  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2656  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
86 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0134308  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
88 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
89 aa  104  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
93 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 
84 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 
100 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  2.71812e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 
89 aa  104  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
90 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3105  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
86 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 
100 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 
85 aa  104  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  1.36289e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 
87 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>