More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0089 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0089  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
102 aa  199  1e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199465  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0129  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
102 aa  199  1e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0098  50S ribosomal protein L21  99.02 
 
 
102 aa  197  4e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0183  50S ribosomal protein L21  89.22 
 
 
102 aa  176  8e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1538  50S ribosomal protein L21  78.43 
 
 
102 aa  160  4e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0997  50S ribosomal protein L21  77.23 
 
 
104 aa  158  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1340  50S ribosomal protein L21  77.45 
 
 
102 aa  155  2e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0383215  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1724  50S ribosomal protein L21  76.24 
 
 
104 aa  154  4e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0502  ribosomal protein L21  66.67 
 
 
102 aa  134  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1416  50S ribosomal protein L21  62.75 
 
 
102 aa  128  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.62091e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  1.74433e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
104 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  47.52 
 
 
131 aa  94  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  92  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
102 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59032e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  91.7  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  44.66 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  46.6 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  6.34591e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
105 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  90.9  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  44.66 
 
 
103 aa  90.5  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.80256e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  90.1  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
102 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  3.99206e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
105 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
102 aa  88.6  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  88.2  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  88.2  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  7.89228e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  45.1 
 
 
101 aa  87.8  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  4.86349e-08  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  87.4  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.81262e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.93081e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  87  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  87  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.28697e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
104 aa  87  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  87  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  87  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  4.50477e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
103 aa  86.7  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  9.15025e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  2.05057e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  1.032e-07  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  1.78483e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  6.19372e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  43.69 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  1.90707e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.86548e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.68941e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.40365e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  3.3092e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  39.22 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.56676e-07  decreased coverage  3.56458e-06 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  6.50093e-10  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
101 aa  85.1  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  40.2 
 
 
149 aa  84.3  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
102 aa  84.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  3.16052e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  2.76317e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  84.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
102 aa  84.3  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  6.94207e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  84.3  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  2.45664e-09  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  41 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  40.78 
 
 
104 aa  84  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  1.52954e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  41 
 
 
188 aa  84.3  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  40.59 
 
 
103 aa  84.3  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.21247e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  84  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 
102 aa  84  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 
102 aa  84  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.39742e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
136 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  41 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  83.6  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  83.6  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  2.65275e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  43.69 
 
 
156 aa  83.6  1e-15  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.1212e-14  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  82.8  1e-15  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>