12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0088 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0088  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  798    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.259915  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0128  hypothetical protein  98.75 
 
 		 400 aa  788    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0182  hypothetical protein  59.75 
 
 		 385 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0097  putative periplasmic protein  91.79 
 
 		 311 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0086  periplasmic protein  30.79 
 
 		 435 aa  176  5e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1523  hypothetical protein  27.46 
 
 		 423 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0133  hypothetical protein  31.25 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.581499  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2790  periplasmic protein  26.11 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5699  hypothetical protein  26.36 
 
 		 447 aa  90.9  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1237  hypothetical protein  25.07 
 
 		 484 aa  87.8  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3849  hypothetical protein  25.47 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0636697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0418  hypothetical protein  24.57 
 
 		 551 aa  70.5  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>