38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0086 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0086  putative lipoprotein  100 
 
 
207 aa  417  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0126  putative lipoprotein  98.55 
 
 
207 aa  414  1e-115  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0084  hypothetical protein  46.63 
 
 
202 aa  177  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1191  membrane lipoprotein lipid attachment site  44.5 
 
 
207 aa  168  5e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00328821  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0180  conserved hypothetical lipoprotein  43.54 
 
 
209 aa  161  6e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3851  membrane lipoprotein lipid attachment site  36.99 
 
 
199 aa  132  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.160992  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2792  hypothetical protein  37.42 
 
 
207 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004000  putative lipoprotein  31.4 
 
 
196 aa  81.6  7e-15  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01522  hypothetical protein  30.81 
 
 
195 aa  79.7  3e-14  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1484  putative lipoprotein  29.41 
 
 
196 aa  79.3  3e-14  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.233925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3947  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.63 
 
 
200 aa  77.8  1e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.91679e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0596  putative lipoprotein  27.62 
 
 
200 aa  75.5  5e-13  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1298  putative lipoprotein  30.05 
 
 
196 aa  72.4  4e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.41074  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5474  putative lipoprotein  34.21 
 
 
195 aa  70.9  1e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1812  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.63 
 
 
204 aa  68.9  5e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2914  hypothetical protein  27.72 
 
 
201 aa  68.9  5e-11  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  4.21511e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3015  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.73 
 
 
201 aa  68.9  5e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1060  hypothetical protein  27.84 
 
 
197 aa  68.2  9e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0964  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.73 
 
 
197 aa  67.8  1e-10  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0219897  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0824  membrane lipoprotein lipid attachment site  27.45 
 
 
201 aa  67.4  1e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.525373  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2065  putative lipoprotein  29.63 
 
 
196 aa  67.8  1e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.274451  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0935  hypothetical protein  27.27 
 
 
201 aa  66.6  2e-10  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.06943e-07  normal  0.0868767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0898  hypothetical protein  27.27 
 
 
201 aa  66.6  2e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.38757e-05  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3039  hypothetical protein  27.27 
 
 
201 aa  66.6  2e-10  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000888459  normal  0.414715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0606  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.28 
 
 
205 aa  65.9  4e-10  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0836  membrane lipoprotein lipid attachment site  27.93 
 
 
197 aa  66.2  4e-10  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0143317  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0637  hypothetical protein  25.87 
 
 
201 aa  65.9  4e-10  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0353203  normal  0.98697 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3403  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.7 
 
 
197 aa  65.5  5e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00726225  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3601  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.7 
 
 
201 aa  65.1  6e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0884  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.7 
 
 
201 aa  65.1  6e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000370182  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3478  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.7 
 
 
201 aa  65.1  6e-10  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0966746  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1313  membrane lipoprotein lipid attachment site  27.37 
 
 
196 aa  65.1  7e-10  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.565237  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1891  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.1 
 
 
204 aa  64.7  9e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0633  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.87 
 
 
196 aa  64.7  1e-09  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2514  putative lipoprotein  31.12 
 
 
204 aa  63.9  2e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3243  hypothetical protein  26.7 
 
 
201 aa  62.8  3e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126868  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0914  hypothetical protein  25.25 
 
 
201 aa  61.2  1e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.310752  normal  0.0133601 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4205  hypothetical protein  27.78 
 
 
208 aa  55.1  6e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>