40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0084 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0124  putative lipoprotein  97.35 
 
 
453 aa  835  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0084  putative lipoprotein  100 
 
 
453 aa  906  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0179  conserved hypothetical lipoprotein  55.51 
 
 
448 aa  508  1e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1193  hypothetical protein  30.62 
 
 
457 aa  190  5e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.01113  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0082  hypothetical protein  32.55 
 
 
504 aa  180  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3852  hypothetical protein  30.24 
 
 
457 aa  170  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.506454  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2794  sporulation domain-containing protein  28.04 
 
 
671 aa  113  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3477  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 
467 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0100527  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0885  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 
467 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.89506e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0936  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 
466 aa  100  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  9.2283e-06  normal  0.106042 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0899  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 
466 aa  99.8  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  3.07995e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0965  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 
455 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115055  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3038  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
466 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  5.5247e-05  normal  0.645895 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1061  TPR domain-containing protein  26.12 
 
 
466 aa  98.6  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3600  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 
467 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  9.96774e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0638  TPR domain-containing protein  23.89 
 
 
459 aa  95.9  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.044891  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.33 
 
 
467 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0332171  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3014  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 
467 aa  93.6  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00235052  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0915  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 
455 aa  93.2  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0669152  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3242  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 
456 aa  90.1  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0125577  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0825  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 
455 aa  89  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.692927  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2913  tetratricopeptide TPR_2  23.65 
 
 
453 aa  89  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  6.025e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0837  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
469 aa  87  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0598  putative lipoprotein  23.51 
 
 
483 aa  85.5  2e-15  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5472  hypothetical protein  23.67 
 
 
464 aa  85.5  2e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3949  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 
487 aa  80.1  7e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  6.98733e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1296  putative lipoprotein  23.26 
 
 
465 aa  78.2  3e-13  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2516  hypothetical protein  23.54 
 
 
509 aa  76.3  1e-12  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219773 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01520  hypothetical protein  21.95 
 
 
468 aa  72.8  1e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004002  putative lipoprotein  22.43 
 
 
465 aa  70.5  7e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0604  hypothetical protein  23.15 
 
 
559 aa  68.9  2e-10  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243924  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1486  hypothetical protein  22.54 
 
 
472 aa  65.9  1e-09  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00338852  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2334  hypothetical protein  20.94 
 
 
461 aa  59.3  1e-07  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  6.14425e-07  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1905  hypothetical protein  22.89 
 
 
452 aa  57  6e-07  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1831  tetratricopeptide TPR_4  26.76 
 
 
441 aa  56.6  1e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2263  hypothetical protein  22.74 
 
 
435 aa  53.5  7e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.156064  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0190  hypothetical protein  22.25 
 
 
434 aa  52.4  2e-05  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5471  hypothetical protein  19.81 
 
 
457 aa  51.2  4e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0735646 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0064  hypothetical protein  21.55 
 
 
477 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1218  TPR repeat-containing protein  22.38 
 
 
486 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.411043  normal  0.543681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>