130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0083 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0123  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  98.87 
 
 
442 aa  862  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0095  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  97.74 
 
 
442 aa  790  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0139  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  90.25 
 
 
444 aa  728  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0083  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  100 
 
 
442 aa  870  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1117  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  68.79 
 
 
444 aa  580  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1644  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  66.74 
 
 
445 aa  546  1e-154  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1556  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  57.17 
 
 
497 aa  535  1e-151  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678975  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1912  hypothetical protein  62.02 
 
 
446 aa  526  1e-148  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  4.8049e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0390  IspD/IspF bifunctional enzyme  59.78 
 
 
447 aa  489  1e-137  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.889279  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2007  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  58.6 
 
 
433 aa  488  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3893  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family protein  53.36 
 
 
433 aa  464  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0588  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  53.71 
 
 
435 aa  440  1e-122  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3408  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  54.93 
 
 
433 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0639  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  53.62 
 
 
433 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0617  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  53.62 
 
 
433 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3748  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  53.62 
 
 
433 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0325  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  55.66 
 
 
433 aa  423  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  4.34648e-05 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0681  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family protein  54.48 
 
 
415 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3533  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  55.18 
 
 
433 aa  419  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0505  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  56.79 
 
 
433 aa  416  1e-115  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0724  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  57.77 
 
 
433 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4379  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  53.39 
 
 
433 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0860444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03970  hypothetical protein  53.39 
 
 
433 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4667  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  53.39 
 
 
433 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.654313  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5654  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  53.39 
 
 
433 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00371648  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4607  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  53.39 
 
 
433 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.104112  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3874  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  53.39 
 
 
433 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3854  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  53.39 
 
 
433 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04008  C4-dicarboxylate antiporter  53.39 
 
 
433 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4693  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  53.17 
 
 
433 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4721  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  53.39 
 
 
433 aa  406  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0855825  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4595  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  53.39 
 
 
433 aa  406  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0644  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  53.71 
 
 
415 aa  405  1e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4686  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  53.39 
 
 
433 aa  406  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4743  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  53.39 
 
 
433 aa  406  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.722845 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4603  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  53.39 
 
 
433 aa  406  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0405  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  52.94 
 
 
433 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219267  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2701  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  51.03 
 
 
433 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1910  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  50.6 
 
 
433 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0126461  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3826  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  52.38 
 
 
433 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0726  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  52.38 
 
 
433 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3679  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  52.38 
 
 
433 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002213  C4-dicarboxylate transporter anaerobic  52.76 
 
 
435 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00155  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  52.52 
 
 
435 aa  371  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2271  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  52.3 
 
 
435 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04830  anaerobic c4-dicarboxylate membrane transporter family protein  50 
 
 
432 aa  340  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.664542 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1089  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.24 
 
 
432 aa  303  4e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2657  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  38.83 
 
 
433 aa  292  9e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  5.44517e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1605  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  39.55 
 
 
441 aa  288  9e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3278  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  38.14 
 
 
443 aa  276  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.737723 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2084  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  39.35 
 
 
453 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1756  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.82 
 
 
453 aa  273  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2005  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  39.55 
 
 
433 aa  272  8e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0366  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  40.91 
 
 
437 aa  272  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3845  anaerobic c4-dicarboxylate membrane transporter family protein  37.44 
 
 
441 aa  271  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0240  hypothetical protein  37 
 
 
439 aa  271  2e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2178  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  39.47 
 
 
453 aa  270  3e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0209  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  40.99 
 
 
423 aa  269  6e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0441  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  40.23 
 
 
437 aa  266  7e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0685  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.19 
 
 
438 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4883  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  40.23 
 
 
437 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3974  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.5 
 
 
439 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0378  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  40.23 
 
 
437 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0354  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  40.23 
 
 
437 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0364  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  40.23 
 
 
437 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0421  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  40.45 
 
 
437 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0488  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  40.23 
 
 
437 aa  264  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0359  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  40.23 
 
 
437 aa  263  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3793  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.05 
 
 
439 aa  263  5e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261131  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3913  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.05 
 
 
439 aa  263  5e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.689386  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3805  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.05 
 
 
439 aa  263  5e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1227  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  39.06 
 
 
437 aa  263  6e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0182987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0489  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  40 
 
 
437 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0351  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  39.77 
 
 
437 aa  262  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3871  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.83 
 
 
439 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0593006  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3841  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.1 
 
 
438 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0158  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  39.87 
 
 
436 aa  257  3e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4417  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.47 
 
 
447 aa  256  6e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3726  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.25 
 
 
447 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2751  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.7 
 
 
442 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2120  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.95 
 
 
441 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.20125  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0293  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.5 
 
 
447 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600202 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0293  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.5 
 
 
447 aa  250  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2855e-06 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0307  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.14 
 
 
447 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0298  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37 
 
 
447 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0302  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37 
 
 
447 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0303  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37 
 
 
447 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3540  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.54 
 
 
442 aa  247  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000247021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1304  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.83 
 
 
443 aa  247  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33068e-14 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1566  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  35.76 
 
 
441 aa  246  5e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2921  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.61 
 
 
443 aa  245  1e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3993  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.08 
 
 
440 aa  245  1e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  1.71498e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05690  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  35.6 
 
 
443 aa  242  9e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000075  C4-dicarboxylate like transporter  35.84 
 
 
443 aa  240  3e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.834607  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1023  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  34.73 
 
 
442 aa  239  9e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1726  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  35.48 
 
 
447 aa  234  2e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2500  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  35.33 
 
 
447 aa  234  2e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1800  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  35.48 
 
 
447 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.920741  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4182  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.18 
 
 
441 aa  233  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.877677 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2479  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  34.63 
 
 
447 aa  232  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>