240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0081 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
231 aa  465  1e-130  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  99.13 
 
 
231 aa  462  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  96.97 
 
 
231 aa  455  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  73.13 
 
 
229 aa  342  3e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  60.79 
 
 
232 aa  290  1e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  59.91 
 
 
230 aa  282  3e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  59.91 
 
 
235 aa  280  2e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1111  uracil-DNA glycosylase  59.03 
 
 
231 aa  276  2e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  53.6 
 
 
223 aa  254  7e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  51.57 
 
 
232 aa  247  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  52.68 
 
 
231 aa  247  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
241 aa  245  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  53.39 
 
 
240 aa  245  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  3.21985e-05  hitchhiker  1.31635e-09 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  52.02 
 
 
230 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  52.47 
 
 
230 aa  242  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  49.32 
 
 
235 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  51.79 
 
 
229 aa  242  4e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  52.47 
 
 
230 aa  241  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  52.19 
 
 
231 aa  241  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  50.67 
 
 
269 aa  241  7e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  5.1966e-11  hitchhiker  5.89305e-06 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  52.02 
 
 
230 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
233 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  52.47 
 
 
230 aa  239  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  51.75 
 
 
231 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  49.78 
 
 
245 aa  239  3e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  51.57 
 
 
230 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  51.57 
 
 
231 aa  238  6e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  53.64 
 
 
220 aa  238  7e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  53.18 
 
 
221 aa  237  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  50.67 
 
 
229 aa  237  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  49.12 
 
 
247 aa  235  5e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  52.04 
 
 
222 aa  234  1e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  47.06 
 
 
233 aa  233  2e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  48.66 
 
 
222 aa  231  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  53.49 
 
 
225 aa  229  3e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  48.43 
 
 
243 aa  228  7e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  51.38 
 
 
225 aa  228  9e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  50.47 
 
 
228 aa  225  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  49.54 
 
 
221 aa  224  8e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  51.82 
 
 
224 aa  223  1e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  50.71 
 
 
218 aa  223  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  48.89 
 
 
261 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  49.53 
 
 
228 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  50.47 
 
 
228 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  50.47 
 
 
228 aa  222  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  48.86 
 
 
229 aa  222  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1229  putative uracil-DNA glycosylase  48.62 
 
 
218 aa  222  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  47.47 
 
 
229 aa  222  5e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.00069e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  47.47 
 
 
229 aa  222  5e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  47.47 
 
 
229 aa  222  5e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  47.47 
 
 
229 aa  222  5e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  47.47 
 
 
229 aa  221  6e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  47.47 
 
 
229 aa  221  6e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0054  uracil-DNA glycosylase  52 
 
 
223 aa  221  6e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0246  uracil-DNA glycosylase  48.64 
 
 
221 aa  221  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388102 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  52.04 
 
 
223 aa  221  1e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  47 
 
 
229 aa  220  1e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  46.58 
 
 
229 aa  220  1e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  47 
 
 
229 aa  220  1e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  47 
 
 
229 aa  219  2e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  48.43 
 
 
225 aa  219  2e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  49.55 
 
 
225 aa  219  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  49.11 
 
 
221 aa  219  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  48.4 
 
 
244 aa  218  7e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  49.09 
 
 
225 aa  217  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  49.32 
 
 
223 aa  217  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  49.78 
 
 
221 aa  216  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  43.64 
 
 
245 aa  216  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12267  predicted protein  46.33 
 
 
227 aa  216  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  48.39 
 
 
226 aa  216  3e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  48.15 
 
 
217 aa  215  4e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  2.82189e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  45.05 
 
 
241 aa  215  5e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  46.33 
 
 
223 aa  215  6e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  47.96 
 
 
224 aa  214  6e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  47.49 
 
 
224 aa  214  8e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  3.1363e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  49.11 
 
 
225 aa  213  3e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  46.58 
 
 
229 aa  212  3e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  45.45 
 
 
237 aa  212  3e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  46.79 
 
 
229 aa  212  3e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  47.91 
 
 
216 aa  212  4e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  47 
 
 
219 aa  212  5e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  46.76 
 
 
226 aa  211  6e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  46.33 
 
 
229 aa  211  6e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  46.33 
 
 
229 aa  211  6e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  46.33 
 
 
229 aa  211  6e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  46.33 
 
 
229 aa  211  6e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  47.69 
 
 
222 aa  211  6e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  48.13 
 
 
227 aa  211  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  7.21221e-06  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  47.71 
 
 
229 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  44.04 
 
 
225 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  44.98 
 
 
253 aa  210  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3595  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
228 aa  209  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1173  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
228 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0255291  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  44.54 
 
 
253 aa  209  4e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1121  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
228 aa  208  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0977602  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0897  uracil-DNA glycosylase  47.53 
 
 
229 aa  208  7e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4244  uracil-DNA glycosylase  49.46 
 
 
232 aa  207  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106427  normal  0.0153666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  44.7 
 
 
222 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  46.12 
 
 
225 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0613  uracil-DNA glycosylase  49.3 
 
 
222 aa  206  3e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>